145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3566 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3566  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
107 aa  209  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  62.86 
 
 
118 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04972  flagellar hook-basal body protein  60 
 
 
118 aa  90.1  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0222  flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.75 
 
 
110 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  44.86 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.45 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.57 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4418  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.94 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.376569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0078  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.57 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0170  flagellar hook-basal body complex protein FliE  47.89 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703787  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0249  lateral flagellar basal body component protein LfiE  46.43 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.55 
 
 
106 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3383  flagellar hook-basal body complex protein FliE  45.24 
 
 
113 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.409901  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  45.35 
 
 
109 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.35 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0084  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.29 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  37.62 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  37.62 
 
 
109 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  48.48 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.515484  normal  0.151853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0710  flagellar hook-basal body complex protein FliE  48.48 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113201  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0630  flagellar hook-basal body complex protein FliE  48.48 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.78 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.26 
 
 
117 aa  60.5  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  33.66 
 
 
109 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  41.56 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 
105 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  41.56 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  41.56 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  42.86 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.66 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  43.66 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.84 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  38.16 
 
 
100 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.84 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.84 
 
 
104 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.85 
 
 
113 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.71 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.04 
 
 
109 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.61 
 
 
108 aa  52.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.62 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.46 
 
 
111 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.13 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  40.43 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.97 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  30.93 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  30.93 
 
 
123 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  37.84 
 
 
115 aa  50.4  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.14 
 
 
120 aa  50.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.65 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.03 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.74 
 
 
111 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.93 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.72 
 
 
120 aa  48.9  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.26 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.44 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.77 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.74 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.21 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.68 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  36.59 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.21 
 
 
112 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  29.57 
 
 
111 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  36.59 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.88 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.84 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.51 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.63 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.14 
 
 
112 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.6 
 
 
96 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.14 
 
 
112 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.62 
 
 
103 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.91 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  34.88 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  34.41 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  31.91 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.19 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  31.91 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  31.91 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.15 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  36.36 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  34.41 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  30 
 
 
107 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  38.03 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.25 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  34.41 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.25 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.59 
 
 
114 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.21 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  34.41 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.21 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  32.53 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  32.53 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.04 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.25 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  31.43 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>