128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0078 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0078  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 		 112 aa  226  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0084  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  76.79 
 
 		 112 aa  179  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  71.43 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  69.64 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  65.18 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4418  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  66.13 
 
 		 111 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.376569 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  48.84 
 
 		 118 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04972  flagellar hook-basal body protein  47.67 
 
 		 118 aa  84  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  52.94 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.33 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.98 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3566  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.57 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  41.75 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  41.75 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  48.61 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0630  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.5 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.5 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.515484  normal  0.151853 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0710  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.5 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0249  lateral flagellar basal body component protein LfiE  43.66 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3383  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.25 
 
 		 113 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.409901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.67 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.67 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0170  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.67 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.703787  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  43.66 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0222  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.11 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.44 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  38.64 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  38.64 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  38.64 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.86 
 
 		 118 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  41.86 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  39.73 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  35.16 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.16 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.06 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  32.74 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.71 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.68 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.23 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  37.25 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.62 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.26 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.26 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.26 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.26 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.68 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  31.82 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.11 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.62 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  31.86 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  36.25 
 
 		 110 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.36 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.86 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.99 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  37.8 
 
 		 114 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.62 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  33.8 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.84 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.93 
 
 		 110 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  38.36 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  30.84 
 
 		 107 aa  50.4  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  35.62 
 
 		 103 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.78 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.31 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.99 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.57 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  34.29 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.74 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.85 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.72 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  36.62 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.17 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  25.77 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.57 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.88 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.43 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.05 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  32.14 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  26.61 
 
 		 106 aa  47  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3808  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.05 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  30.99 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  30.59 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.06 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  38.36 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  32.39 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.99 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  32.39 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  32.39 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0549  flagellar hook-basal body complex protein  33.8 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  32.39 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  32.39 
 
 		 111 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.39 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>