147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3808 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  99.03 
 
 
103 aa  208  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.507912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3808  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
103 aa  208  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  74.29 
 
 
105 aa  159  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1112  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  67.29 
 
 
107 aa  140  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  67.62 
 
 
109 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0549  flagellar hook-basal body complex protein  66.67 
 
 
105 aa  134  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  54.46 
 
 
110 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.28 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1485  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  52.33 
 
 
102 aa  91.3  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.278584  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2673  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  56.58 
 
 
102 aa  87  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  47.5 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  48.05 
 
 
104 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.72 
 
 
106 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.7 
 
 
113 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  43.02 
 
 
115 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.22 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  43.84 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.57 
 
 
119 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.57 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  43.84 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  47.22 
 
 
135 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.96 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.78 
 
 
105 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  44.3 
 
 
119 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3108  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.57 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2974  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.57 
 
 
119 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231447  normal  0.186966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.67 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.07 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3060  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.48 
 
 
114 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.21 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.23 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0201  flagellar hook-basal body complex protein  45.07 
 
 
114 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6412  flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.27 
 
 
114 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  45.07 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  37.78 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.33 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.3 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  36.62 
 
 
110 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  39.44 
 
 
114 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 
110 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  35.48 
 
 
108 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  41.43 
 
 
105 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  35.21 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.56 
 
 
121 aa  58.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.43 
 
 
120 aa  58.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  35.21 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
112 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  34.25 
 
 
122 aa  57.8  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.13 
 
 
103 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0418  flagellar hook-basal body complex protein  43.94 
 
 
175 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0984144  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
112 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.99 
 
 
111 aa  57.8  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
111 aa  57.4  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.49 
 
 
102 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3282  flagellar hook-basal body complex protein FliE, putative  43.94 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.556445  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2947  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.94 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2141  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.94 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0223  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.94 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0235  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.94 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3399  putative flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.94 
 
 
113 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  34.78 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.62 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  38.55 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.62 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.62 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  28.16 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  34.07 
 
 
104 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.62 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.35 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.84 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  32.97 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36 
 
 
113 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.25 
 
 
117 aa  54.7  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.18 
 
 
113 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  32.88 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.25 
 
 
120 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  34.25 
 
 
107 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  38.64 
 
 
109 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  38.16 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  36.05 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  39.13 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  36.49 
 
 
105 aa  52.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.49 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  36.49 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  36.49 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  38.89 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  36.05 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.72 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.3 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35 
 
 
110 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.18 
 
 
104 aa  51.2  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.95 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>