68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3775 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 101 aa  200  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  93.07 
 
 		 101 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  85.15 
 
 		 101 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  76.19 
 
 		 105 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  73.79 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  73.79 
 
 		 103 aa  143  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  66.67 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.94 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  56.52 
 
 		 100 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  56.52 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.15 
 
 		 106 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.71 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.71 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  41.18 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  39.51 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  36.79 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.73 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  31.73 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  38.82 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  31.73 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.33 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  31.73 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.49 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.23 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.23 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.61 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.67 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  30 
 
 		 100 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.81 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.95 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  29.9 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.33 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.21 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.39 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.36 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.21 
 
 		 117 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  33.75 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  27.27 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  32.89 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.41 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.21 
 
 		 117 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.56 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.43 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  30.99 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.77 
 
 		 96 aa  43.9  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.57 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  28 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.99 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  29.63 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  29.63 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  42.86 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  42.86 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.68 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.55 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  34.02 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  31.17 
 
 		 109 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.25 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1643  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.05 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00083398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.36 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  30.39 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1574  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.51 
 
 		 148 aa  41.2  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  27.5 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.39 
 
 		 106 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  32.95 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.27 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  25.3 
 
 		 108 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  25.3 
 
 		 108 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.743066 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>