54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2963 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 98 aa  200  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  56.12 
 
 		 96 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  59.18 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  55.1 
 
 		 96 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  54.08 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  55.1 
 
 		 95 aa  87.4  6e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  52.54 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  47.46 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.4 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.1 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.1 
 
 		 107 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.26 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.43 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  28.87 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.78 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.78 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.08 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  29.9 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  38.98 
 
 		 106 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  29.9 
 
 		 101 aa  47.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  38.98 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  31.46 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  34.48 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  38.33 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  37.04 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  39.22 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  37.14 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.07 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.71 
 
 		 114 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.52 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.52 
 
 		 117 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  32.76 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.71 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  29.33 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.25 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  52.63 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  32.81 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2558  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.34 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00862222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2462  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.34 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00184271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1395  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  46.34 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00257587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  27.84 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.63 
 
 		 99 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2348  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.31 
 
 		 105 aa  41.6  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  24.49 
 
 		 100 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.67 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  52.78 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  40.98 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  25.27 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.46 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>