36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1096 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 106 aa  205  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  55.71 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  57.97 
 
 		 114 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  60.87 
 
 		 112 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  62.16 
 
 		 117 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  62.16 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  62.16 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  61.43 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0351  flagellar hook-basal body protein FliE  38 
 
 		 113 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0319  flagellar hook-basal body protein FliE  39 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  36 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  48.24 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  43.37 
 
 		 111 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  47.06 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  46.91 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  43.53 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  37.65 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  37.65 
 
 		 96 aa  57  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  37.84 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1142  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.56 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.25 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  49.15 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.78 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  38.98 
 
 		 98 aa  48.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  43.64 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.46 
 
 		 107 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.36 
 
 		 106 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.68 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.92 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 102 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  30.39 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.62 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.46 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>