33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0738 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 124 aa  244  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0351  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 		 113 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0319  flagellar hook-basal body protein FliE  49 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  52.44 
 
 		 111 aa  89.4  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.74 
 
 		 114 aa  84.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  46.99 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  46.34 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.42 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  45.12 
 
 		 111 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.47 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.03 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.03 
 
 		 117 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  36 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.05 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  42.86 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.58 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1142  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.68 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  36.84 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.76 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.14 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.78 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.59 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.85 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.9 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  28.99 
 
 		 96 aa  42  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.9 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  32.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  32.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.75 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.75 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 106 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.15 
 
 		 106 aa  40  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>