111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2829 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
107 aa  209  7e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
107 aa  209  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  97.2 
 
 
106 aa  177  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  61.82 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  57.41 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  47.22 
 
 
101 aa  87.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  62.86 
 
 
101 aa  87  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  50.6 
 
 
103 aa  83.6  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  47 
 
 
118 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  46.73 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  43.52 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  42.59 
 
 
101 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.33 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  43.64 
 
 
105 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.89 
 
 
92 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  44.93 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  44.93 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  45.33 
 
 
106 aa  61.2  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  44.59 
 
 
111 aa  60.8  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  43.24 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.58 
 
 
100 aa  58.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.64 
 
 
113 aa  58.2  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  43.24 
 
 
111 aa  57.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  41.9 
 
 
95 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  38.57 
 
 
96 aa  55.1  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.57 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.39 
 
 
117 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.33 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.82 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.13 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.47 
 
 
110 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  41.03 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  37.1 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  36.84 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  35.9 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.75 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.43 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  28.57 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.36 
 
 
95 aa  47.8  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.29 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.88 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.88 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  34.29 
 
 
100 aa  47  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.35 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.29 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  37.14 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  39.68 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.58 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  32.86 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.43 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  31.43 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  48.94 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4167  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.72 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2348  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.96 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.78 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  34.78 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.94 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1574  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.21 
 
 
148 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.91 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0056  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  28.21 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.99 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.39 
 
 
109 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
107 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.07 
 
 
118 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  29.07 
 
 
111 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.71 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.68 
 
 
108 aa  43.5  0.0009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.62 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  31.4 
 
 
109 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  29.73 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.89 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.27 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04972  flagellar hook-basal body protein  32.5 
 
 
118 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  32.43 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  36.62 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  29.75 
 
 
121 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1142  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.3 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.77 
 
 
110 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.21 
 
 
102 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.26 
 
 
112 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.95 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
111 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.68 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  34.21 
 
 
114 aa  41.2  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.33 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  28.74 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  31.15 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.21 
 
 
111 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.19 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.58 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  28 
 
 
109 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  30.99 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>