43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1690 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 
110 aa  214  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  58.41 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  65.88 
 
 
117 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  65.88 
 
 
117 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  65.88 
 
 
117 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  58.54 
 
 
104 aa  87  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  45.37 
 
 
111 aa  84  7e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  59.42 
 
 
114 aa  83.6  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  46.79 
 
 
111 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  44.44 
 
 
111 aa  82  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  61.43 
 
 
106 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  45.87 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  44.05 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  45.78 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0319  flagellar hook-basal body protein FliE  41.57 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0351  flagellar hook-basal body protein FliE  42.86 
 
 
113 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  39.74 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  49.23 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.67 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.03 
 
 
100 aa  52  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.47 
 
 
107 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1142  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.46 
 
 
110 aa  52  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  38.75 
 
 
95 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.47 
 
 
107 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.47 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  45.45 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  45.45 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  43.08 
 
 
92 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  33.72 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  39.33 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.43 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.13 
 
 
100 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  32.56 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.89 
 
 
113 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  51.22 
 
 
92 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  30.43 
 
 
105 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  46.15 
 
 
106 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.93 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  35.71 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  30.43 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.68 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  29.87 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>