83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1519 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 105 aa  206  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  76.19 
 
 		 103 aa  150  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  76.19 
 
 		 101 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  73.33 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  73.33 
 
 		 101 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  71.03 
 
 		 101 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  67 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.07 
 
 		 104 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  51.9 
 
 		 100 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50.72 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.24 
 
 		 106 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.28 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  49.28 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.69 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  34.34 
 
 		 106 aa  62.4  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  37.08 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.67 
 
 		 107 aa  60.1  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.14 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  31.37 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  33.02 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  34.85 
 
 		 95 aa  52  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  31.37 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  33.68 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.72 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.77 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  35.71 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.26 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.26 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  25.53 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  35.44 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  32.63 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  35.44 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  35.44 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  30.39 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.77 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.77 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.95 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.34 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.6 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  30.53 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  34.67 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  36.49 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.59 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.59 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.53 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  31.58 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  29.49 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.56 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  30.99 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.41 
 
 		 112 aa  45.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.58 
 
 		 104 aa  45.1  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.43 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.58 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  27.06 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  25.71 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  24.72 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0084  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.82 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  25.74 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.16 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.94 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  29.58 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  28.41 
 
 		 108 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.27 
 
 		 112 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  25.93 
 
 		 95 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  24.72 
 
 		 98 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  28.41 
 
 		 108 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  30.99 
 
 		 111 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.84 
 
 		 108 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  30.99 
 
 		 111 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  27.5 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.78 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.78 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.67 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.25 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  23.96 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.54 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  25.27 
 
 		 98 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.72 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  27.71 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  30.99 
 
 		 110 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.55 
 
 		 106 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>