176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2270 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 		 121 aa  237  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  47.19 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.23 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.78 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.26 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.14 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.21 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.71 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.68 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.53 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1643  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.34 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00083398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.79 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  38.1 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.97 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.27 
 
 		 96 aa  57  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  38.55 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  28.57 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.04 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  30.3 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  52.08 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.9 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.59 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.24 
 
 		 105 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  31.71 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.31 
 
 		 110 aa  54.3  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.17 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.71 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.31 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  28.95 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  33.67 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.3 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.56 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.21 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.18 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  37.84 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.47 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.21 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  33.71 
 
 		 109 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.55 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  35.29 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.55 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  31.17 
 
 		 117 aa  50.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  32.89 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.66 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  25.84 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.66 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.41 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  36.25 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.75 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.71 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.41 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.41 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.29 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  35.29 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  52.63 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.66 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.46 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.66 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  29.55 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.6 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.43 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.95 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3082  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.46 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.66 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.14 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.46 
 
 		 106 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3108  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.17 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.39 
 
 		 111 aa  48.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2974  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.17 
 
 		 119 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.231447  normal  0.186966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.89 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  30.43 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  31.3 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.75 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.27 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.08 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  34.07 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.91 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.91 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.77 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  25 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.29 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.96 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  29.21 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.34 
 
 		 122 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.07 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  32.63 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.67 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  28.57 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  32.63 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2930  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.38 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  32.63 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>