125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3028 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
107 aa  218  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  54.05 
 
 
111 aa  114  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  55.45 
 
 
110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  53.21 
 
 
109 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1574  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  56.34 
 
 
148 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.38 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.71 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.46 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.46 
 
 
94 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.04 
 
 
95 aa  68.6  0.00000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.96 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  41.33 
 
 
100 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.37 
 
 
102 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  38.75 
 
 
100 aa  64.7  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.97 
 
 
99 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.93 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  39.13 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32 
 
 
102 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  38.36 
 
 
98 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 
96 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 
114 aa  60.5  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.68 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.9 
 
 
101 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.62 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.39 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 
103 aa  58.5  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.91 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.27 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  36.78 
 
 
121 aa  54.7  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.12 
 
 
102 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  39.44 
 
 
107 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.84 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.23 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  31.03 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.25 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  28.77 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  43.28 
 
 
115 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 
107 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1395  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.23 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00257587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2462  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.23 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00184271  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2558  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.23 
 
 
95 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00862222  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.95 
 
 
104 aa  50.1  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  24.76 
 
 
114 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1643  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.21 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00083398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  28.75 
 
 
121 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  39.71 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.68 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  35.71 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  31.08 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2718  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.57 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0637  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.23 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.76 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  31.4 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  35.71 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  35.14 
 
 
110 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.89 
 
 
110 aa  47  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.42 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  32.97 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0363  flagellar hook-basal body protein FliE  26.42 
 
 
99 aa  47  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  35.71 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.27 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  34.29 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  37.14 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  37.14 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  32.39 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.58 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  34.29 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  31.43 
 
 
98 aa  45.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  32.91 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  34.29 
 
 
110 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.82 
 
 
121 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  31.65 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  32.91 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.82 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.88 
 
 
108 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  31.65 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  31.65 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  31.65 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0052  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.21 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.280987  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.85 
 
 
117 aa  44.7  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  35.71 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.24 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.82 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0056  flagellar hook-basal body protein FliE  30.99 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.91 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2348  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42 
 
 
105 aa  43.9  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  34.33 
 
 
111 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  34.33 
 
 
111 aa  43.5  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.25 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.25 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3956  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.87 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1116  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.8 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>