130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0760 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 		 105 aa  213  5.9999999999999996e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  58.02 
 
 		 110 aa  101  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  45.54 
 
 		 114 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  51.14 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  55.71 
 
 		 109 aa  90.9  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2348  flagellar hook-basal body complex protein FliE  56 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0840  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.86 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2992  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.33 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  36.54 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.18 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.31 
 
 		 99 aa  65.9  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.96 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.27 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.65 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.77 
 
 		 99 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.14 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  32.35 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  34.52 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.64 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.91 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  31.73 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  32.91 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.25 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.3 
 
 		 96 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.85 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.02 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  30.53 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.18 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.02 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.07 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.89 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.02 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.02 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.24 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.62 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.25 
 
 		 107 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2718  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40 
 
 		 106 aa  53.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  32.95 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.33 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.33 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.99 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0056  flagellar hook-basal body protein FliE  32.58 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.82 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.82 
 
 		 107 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.95 
 
 		 118 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.82 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  28.16 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  34.18 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.17 
 
 		 111 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.11 
 
 		 110 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.1 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.88 
 
 		 98 aa  50.1  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0630  flagellar hook-basal body protein FliE  30.23 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.632704  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.33 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.16 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0551  flagellar hook-basal body protein FliE  30.23 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  29.07 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  26.42 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  30.48 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  32.58 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  30.95 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  34.67 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  30.95 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  28.57 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1067  flagellar hook-basal body protein FliE  30.14 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  32.14 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.72 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.17 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.17 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  28.57 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.06 
 
 		 122 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1640  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.82 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10921  normal  0.819271 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  31.17 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.21 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.96 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  31.17 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0363  flagellar hook-basal body protein FliE  26.47 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  32 
 
 		 105 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.03 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  32.88 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  32.39 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.25 
 
 		 120 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  32.56 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  30.56 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  30.56 
 
 		 108 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.73 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  35.62 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  33.8 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>