51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3249 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 92 aa  185  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  60.42 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  63.27 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  59.38 
 
 		 96 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  60 
 
 		 95 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  59.18 
 
 		 98 aa  100  6e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  45.05 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.19 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.19 
 
 		 117 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.08 
 
 		 110 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  33.77 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  39.24 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  38.98 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  43.64 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.49 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  37.74 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  42 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.68 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.68 
 
 		 106 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.68 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  35.59 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  32.89 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  29.49 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  45.61 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  35.59 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.78 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.34 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  44.44 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.71 
 
 		 114 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.59 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.64 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  33.9 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  38.18 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  39.58 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  38.18 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  33.9 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.37 
 
 		 102 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.43 
 
 		 100 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.74 
 
 		 99 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  40.48 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  35.19 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.11 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0319  flagellar hook-basal body protein FliE  32.05 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2558  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.34 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00862222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2462  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.34 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00184271  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.99 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1395  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  46.34 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00257587  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.14 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.14 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>