43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2602 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 96 aa  186  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  83.33 
 
 		 96 aa  159  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  83.33 
 
 		 96 aa  158  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  63.27 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  55 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  54.08 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  47.87 
 
 		 92 aa  78.2  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.74 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  37.84 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 		 107 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.44 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  41.56 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.24 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.24 
 
 		 117 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.97 
 
 		 117 aa  52.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.16 
 
 		 112 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.35 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  34 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  44.62 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.82 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  31.58 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  31.58 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  33.01 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  30.26 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  42.86 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.91 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  34.02 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.14 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  35.14 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.33 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  31.76 
 
 		 102 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.38 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  32.91 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  31.58 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  34.02 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  28.99 
 
 		 124 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.85 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  32.95 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  30.61 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.08 
 
 		 110 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>