84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5153 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 
101 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  84.16 
 
 
100 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  59.62 
 
 
104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  50.53 
 
 
101 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  58.33 
 
 
106 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  50.53 
 
 
101 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  62.86 
 
 
107 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  62.86 
 
 
107 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  49.48 
 
 
101 aa  84.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  45.63 
 
 
103 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  43.81 
 
 
105 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  49 
 
 
118 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  43.69 
 
 
103 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.52 
 
 
107 aa  75.1  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  42.72 
 
 
106 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.58 
 
 
113 aa  67  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  44.93 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  41.25 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  40 
 
 
111 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  36.9 
 
 
121 aa  54.3  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  35.96 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  44.93 
 
 
106 aa  52.4  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.5 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.33 
 
 
110 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  39.53 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  30.77 
 
 
107 aa  51.6  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.94 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  33.71 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.47 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  33.71 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.47 
 
 
117 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  53.66 
 
 
100 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.09 
 
 
106 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  31.94 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  31.94 
 
 
111 aa  47.8  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  40.58 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  30.49 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.25 
 
 
117 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.5 
 
 
104 aa  47  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.92 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  25.29 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.79 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.11 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.11 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  25.29 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.74 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.86 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.4 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.63 
 
 
102 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.16 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.14 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.14 
 
 
123 aa  43.9  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.52 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  28.26 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.27 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1142  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  43.9 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  28.57 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.51 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.49 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.5 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  28.41 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.27 
 
 
111 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  29.27 
 
 
105 aa  41.6  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  28.57 
 
 
102 aa  41.6  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.93 
 
 
110 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  29.21 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.99 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.59 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.74 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0351  flagellar hook-basal body protein FliE  29.67 
 
 
113 aa  40.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  28.72 
 
 
109 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1711  flagellar hook-basal body protein FliE  25.27 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  30.59 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3060  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.58 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  29.7 
 
 
102 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  26.51 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  38.46 
 
 
106 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  27.91 
 
 
110 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4396  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.46 
 
 
105 aa  40  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.51 
 
 
106 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>