42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3675 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 		 112 aa  216  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  60.17 
 
 		 117 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  58.47 
 
 		 117 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  60.17 
 
 		 117 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  58.41 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  66.67 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  54.32 
 
 		 111 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  54.32 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  60.87 
 
 		 106 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  53.09 
 
 		 111 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  51.85 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  45.63 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0351  flagellar hook-basal body protein FliE  43.59 
 
 		 113 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0319  flagellar hook-basal body protein FliE  42.31 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  46.05 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  42.47 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  43.21 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1142  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.39 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.55 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.48 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.44 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  38.16 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  31.82 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.24 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  46.67 
 
 		 102 aa  50.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  39.74 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  39.74 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  30.77 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  30.61 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.58 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  33.8 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  28.43 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  29.59 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.94 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.94 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.94 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  39.34 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  29.09 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  37.18 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.33 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.78 
 
 		 113 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>