77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2112 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 		 92 aa  184  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  48.94 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  48.94 
 
 		 96 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  47.87 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  45.05 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  48.39 
 
 		 95 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  52.54 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.23 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.23 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.98 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.46 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  68.57 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  54.55 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  30.1 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  42.5 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.68 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36 
 
 		 117 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  30.1 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  37.25 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  41.25 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35 
 
 		 117 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  32.35 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.33 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.21 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  38.27 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  30.19 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  29.81 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.96 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.22 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.9 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  36.36 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.22 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0319  flagellar hook-basal body protein FliE  34.31 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  51.22 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.36 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  34.85 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  25.71 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  46.51 
 
 		 98 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.87 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  44.74 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  25.96 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  25.81 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  35.94 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  28.87 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  40.48 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0351  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 113 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.12 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  40.48 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  26.8 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.86 
 
 		 111 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  40.48 
 
 		 102 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.86 
 
 		 99 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.86 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.86 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  44.74 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  45.45 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  44.44 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  44.74 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.86 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.67 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1395  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.59 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00257587  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.63 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2558  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.59 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00862222  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2462  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.59 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00184271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.86 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.09 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.87 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.36 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1142  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.18 
 
 		 110 aa  40.4  0.008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.36 
 
 		 110 aa  40  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.75 
 
 		 114 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>