115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31230 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  100 
 
 		 114 aa  226  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  61.4 
 
 		 110 aa  127  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.54 
 
 		 105 aa  95.5  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  56.25 
 
 		 145 aa  94  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2992  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  71.21 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.67 
 
 		 109 aa  89.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2348  flagellar hook-basal body complex protein FliE  51.85 
 
 		 105 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0840  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.07 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.26 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.24 
 
 		 99 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.67 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.59 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.41 
 
 		 96 aa  62.8  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.24 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.58 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.38 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.37 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.36 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.05 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.21 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.36 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.38 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.05 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.05 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  42.86 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.35 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  38.89 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  41.11 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  38.24 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.64 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.75 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  30.09 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.48 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  34.57 
 
 		 95 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  34.62 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.67 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.16 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.67 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.95 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1067  flagellar hook-basal body protein FliE  37.68 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  37.68 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.94 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.86 
 
 		 110 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 		 102 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.23 
 
 		 103 aa  50.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.23 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.43 
 
 		 111 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.82 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.89 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.53 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.7 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.23 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  24.76 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  35.16 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  35.29 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  35.16 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  35.16 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.35 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  39.13 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.91 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0268  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.43 
 
 		 103 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  34.07 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  28.87 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0630  flagellar hook-basal body protein FliE  29.41 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.632704  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0551  flagellar hook-basal body protein FliE  29.41 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  35.71 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  30.59 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  30.59 
 
 		 123 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  28.24 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  25.71 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.53 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  28.57 
 
 		 107 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  34.94 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  34.52 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  25.61 
 
 		 102 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0363  flagellar hook-basal body protein FliE  27.47 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.18 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  31.4 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  31.82 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3956  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.81 
 
 		 111 aa  42.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.82 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0056  flagellar hook-basal body protein FliE  26.97 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  33.73 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  32.86 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.94 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  30.86 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0078  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.99 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  36.23 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>