65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3440 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 		 113 aa  223  8e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.48 
 
 		 100 aa  66.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  32.69 
 
 		 105 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  35 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  45.07 
 
 		 100 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  47.89 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  42.03 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.44 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  31.43 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.14 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.66 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  40.58 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.62 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.57 
 
 		 104 aa  52  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  34.15 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.25 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 		 106 aa  50.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  32.71 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  32.71 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  38.67 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  43.4 
 
 		 111 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  38.36 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.67 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  36.78 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  37.33 
 
 		 110 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  38.36 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  38.36 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  29.13 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  32.38 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  41.51 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  34.78 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.89 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.36 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2558  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.46 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00862222  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1395  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  41.46 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00257587  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2462  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.46 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00184271  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.25 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0351  flagellar hook-basal body protein FliE  30.48 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  33.77 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  44.74 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  33.77 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  29.21 
 
 		 110 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.78 
 
 		 112 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1539  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.67 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.641952  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.1 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.56 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.56 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.82 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.1 
 
 		 117 aa  41.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.06 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  27.62 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  27.45 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.84 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0319  flagellar hook-basal body protein FliE  29.52 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.44 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.21 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1640  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.72 
 
 		 107 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.10921  normal  0.819271 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>