100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4409 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 101 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  84.16 
 
 		 101 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  85.15 
 
 		 101 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  71.03 
 
 		 105 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  72.38 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  71.15 
 
 		 103 aa  137  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  65.66 
 
 		 118 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.75 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50.55 
 
 		 106 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50.55 
 
 		 100 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 		 107 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  57.97 
 
 		 101 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  39.42 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  42.5 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  46.48 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  41.79 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  33.96 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  35.78 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.43 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  33.96 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.11 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  33.96 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.1 
 
 		 92 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  37.33 
 
 		 121 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.39 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.94 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  36.36 
 
 		 109 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.99 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.99 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.99 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.39 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.91 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  34 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 110 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  28.87 
 
 		 98 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.72 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  35.23 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.8 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  37.74 
 
 		 92 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  29.41 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.65 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.43 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  31.63 
 
 		 96 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  31.96 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.07 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.07 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  31.94 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  31.94 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  31.76 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.33 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.33 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.62 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  28.57 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  33.72 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.56 
 
 		 118 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  31.94 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.63 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.11 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.83 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.47 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0084  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.26 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.18 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.68 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3660  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  31.51 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.25 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1998  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.58 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.695866  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  32.1 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.26 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  25.35 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.88 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  26.21 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  28.57 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  26.21 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.39 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.43 
 
 		 113 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.92 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.43 
 
 		 110 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1142  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.58 
 
 		 110 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.77 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  30.56 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  28.99 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3980  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.08 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.39 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1643  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.67 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00083398  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  27.37 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  25 
 
 		 102 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  29 
 
 		 100 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>