42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1329 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 96 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  98.96 
 
 		 96 aa  186  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  83.33 
 
 		 96 aa  158  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  60.42 
 
 		 92 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  56.12 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  56 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  48.94 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.43 
 
 		 106 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  37.65 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  48.08 
 
 		 106 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  45.45 
 
 		 110 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.74 
 
 		 112 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  45.1 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.44 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.74 
 
 		 107 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.65 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.44 
 
 		 117 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  47.37 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  34.41 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.44 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  31.63 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  29.17 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  30.77 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.88 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.4 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  42.86 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  30.77 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  29.49 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  40.48 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.38 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.68 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  42.86 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  31.33 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  32.14 
 
 		 124 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001185  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.93 
 
 		 118 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.8 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  40.91 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  37.31 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.39 
 
 		 104 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>