41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0257 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 111 aa  215  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0319  flagellar hook-basal body protein FliE  50 
 
 		 113 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0351  flagellar hook-basal body protein FliE  49.14 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  43.75 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  52.59 
 
 		 111 aa  93.6  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  49.15 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  48.31 
 
 		 111 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.74 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  45.87 
 
 		 110 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  55.84 
 
 		 102 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.74 
 
 		 117 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.03 
 
 		 117 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  49.28 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  46.38 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  44.44 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1142  flagellar hook-basal body complex protein FliE  50.7 
 
 		 110 aa  67.4  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  45.95 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  39.08 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.1 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.36 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.78 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.36 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  40.2 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.96 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  53.66 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  38.98 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.71 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.36 
 
 		 110 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.36 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  34.74 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  34.34 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.03 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.58 
 
 		 113 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  34 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  40.91 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  40.91 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.31 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  28.57 
 
 		 103 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>