83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0153 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0153  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 		 111 aa  217  5e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0137  flagellar hook-basal body protein FliE  99.1 
 
 		 111 aa  215  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0604673  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  95.5 
 
 		 111 aa  209  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0257  flagellar hook-basal body protein FliE  49.11 
 
 		 111 aa  90.5  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1142  flagellar hook-basal body complex protein FliE  63.16 
 
 		 110 aa  88.6  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0631  flagellar hook-basal body complex protein FliE  57.89 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.327951  normal  0.219055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0620  flagellar hook-basal body complex protein FliE  57.89 
 
 		 117 aa  87  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.037932  normal  0.0974745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3675  flagellar hook-basal body complex protein FliE  54.32 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0598  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.22 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.24879 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0351  flagellar hook-basal body protein FliE  49.4 
 
 		 113 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.120389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1690  flagellar hook-basal body complex protein FliE  45.37 
 
 		 110 aa  84  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.250714  normal  0.016894 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0296  flagellar hook-basal body protein FliE  54.32 
 
 		 102 aa  80.9  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0319  flagellar hook-basal body protein FliE  46.99 
 
 		 113 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3654  flagellar hook-basal body complex protein FliE  55.56 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.641901  normal  0.427945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0026  flagellar hook-basal body complex protein FliE  56.34 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0738  flagellar hook-basal body protein FliE  46.34 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1096  flagellar hook-basal body protein FliE  48.24 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.357967 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1134  flagellar hook-basal body protein FliE  35.53 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.59 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.24 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.24 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.37 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1368  flagellar hook-basal body protein FliE  44.74 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2824  flagellar hook-basal body protein FliE  43.37 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.870905  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4409  flagellar hook-basal body protein FliE  33.96 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.534404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.19 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5536  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.16 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3775  flagellar hook-basal body protein FliE  31.73 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0512013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1936  flagellar hook-basal body protein FliE  41.46 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.125458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1695  flagellar hook-basal body protein FliE  29.81 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.633905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  36.11 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2132  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.57 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1519  flagellar hook-basal body protein FliE  31.37 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0155915  normal  0.374893 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2112  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.25 
 
 		 92 aa  50.4  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.11 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.11 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5495  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 118 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2602  flagellar hook-basal body protein FliE  31.58 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.716337  hitchhiker  0.000499056 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3440  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.51 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4196  flagellar hook-basal body protein FliE  29.47 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5153  flagellar hook-basal body complex protein FliE  51.22 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285182  normal  0.0256845 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.26 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2990  flagellar hook-basal body protein FliE  30.77 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1329  flagellar hook-basal body protein FliE  30.77 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.68737  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  34.48 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.44 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  37.35 
 
 		 109 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3249  flagellar hook-basal body protein FliE  35.59 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  30.48 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.07 
 
 		 112 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  30.48 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.58 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.07 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.14 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  32.43 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.57 
 
 		 113 aa  43.5  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.14 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.14 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  29.55 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.14 
 
 		 111 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.16 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.97 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  32.5 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  38.03 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.97 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  36.14 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  38.03 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.25 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.55 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  30.86 
 
 		 114 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  34.09 
 
 		 110 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.63 
 
 		 118 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  28.74 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  35.06 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  35.06 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  35.06 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.94 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3956  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.93 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  34.25 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  31.71 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  31.71 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>