117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3956 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3956  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 		 111 aa  224  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  34.09 
 
 		 110 aa  57  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.49 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.85 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.62 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  41.98 
 
 		 113 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.57 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  31.76 
 
 		 121 aa  50.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.06 
 
 		 94 aa  50.4  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.78 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.99 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.68 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.76 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36 
 
 		 106 aa  49.7  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  36.11 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.17 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.27 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.85 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.66 
 
 		 112 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.27 
 
 		 108 aa  47.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  31.82 
 
 		 102 aa  47.8  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.66 
 
 		 112 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.02 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.66 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.66 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.26 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  37.97 
 
 		 114 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  28.26 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.99 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.36 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.99 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.73 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  34.69 
 
 		 112 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  35.71 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0171  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.14 
 
 		 102 aa  47  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.93 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  31.76 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.36 
 
 		 112 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  38.57 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  30.86 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.36 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  30.93 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  30.93 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.77 
 
 		 106 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1015  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.49 
 
 		 122 aa  45.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  30.93 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.36 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.95 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  31.33 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2572  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862498 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  29.9 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  29.9 
 
 		 104 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  30.59 
 
 		 109 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.73 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0268  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1142  flagellar hook-basal body complex protein FliE  28.77 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.93 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  34.29 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  36.11 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  30.61 
 
 		 109 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.67 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.43 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0564  flagellar hook-basal body protein  36.23 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.35 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3477  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  32.39 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.87 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  29.81 
 
 		 114 aa  42.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.39 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  34.25 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0052  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  28.21 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.280987  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  31.4 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  28.57 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4210  flagellar hook-basal body protein FliE  32.93 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  32.53 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  28.57 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  27.96 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  27.96 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  37.5 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  29.76 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  27.35 
 
 		 135 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  31.76 
 
 		 119 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2673  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.88 
 
 		 102 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.269362 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  29.76 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  29.76 
 
 		 110 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1881  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.34 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.664411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  29.49 
 
 		 104 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  29.49 
 
 		 104 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  29.49 
 
 		 104 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  29.49 
 
 		 104 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  29.49 
 
 		 104 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  35.71 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>