136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1649 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
145 aa  282  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  53.57 
 
 
109 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  50.49 
 
 
114 aa  98.6  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  56.47 
 
 
110 aa  97.8  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  51.14 
 
 
105 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2348  flagellar hook-basal body complex protein FliE  61.9 
 
 
105 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0840  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.94 
 
 
102 aa  90.9  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2992  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  56.92 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.85 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.26 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.78 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.86 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.62 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.39 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.66 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3229  flagellar hook-basal body complex protein FliE  40.66 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1341  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.56 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.674522 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 
104 aa  63.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  36.14 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  37.65 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  37.21 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.84 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.73 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.66 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.325302  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2927  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.04 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  37.14 
 
 
100 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.17 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3069  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.04 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.587051 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.17 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1436  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.04 
 
 
111 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.05 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.14 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.94 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.24 
 
 
104 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  40 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2937  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.77 
 
 
111 aa  57.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  33.71 
 
 
98 aa  57.8  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.56 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36 
 
 
110 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1360  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.24 
 
 
110 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.38 
 
 
104 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.06 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.44 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0354  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  33.33 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.51 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.26 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  37.84 
 
 
103 aa  54.7  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.22 
 
 
102 aa  53.9  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.24 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.62 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  39.47 
 
 
114 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  30.36 
 
 
121 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.56 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  35.14 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.25 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.61 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1574  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.72 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.56 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.75 
 
 
106 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  39.24 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.97 
 
 
110 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.89 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1067  flagellar hook-basal body protein FliE  32.88 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0363  flagellar hook-basal body protein FliE  32.98 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3956  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.04 
 
 
111 aa  50.4  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2718  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.94 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.68 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  32.43 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  33.33 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  31.58 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  37.21 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
98 aa  48.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.34 
 
 
109 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0167  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.67 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.14 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3067  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.78 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0052  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  30.68 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.280987  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.72 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.48 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1643  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.11 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00083398  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.53 
 
 
103 aa  47.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0268  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.77 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  38.14 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.7 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  29.63 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.76 
 
 
110 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3769  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.44 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.711308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.71 
 
 
107 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2449  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.64 
 
 
119 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.045554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  37.66 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3063  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.64 
 
 
119 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.136286  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0056  flagellar hook-basal body protein FliE  34.29 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  28.74 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4654  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.29 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.666816  normal  0.472863 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  28.74 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3449  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.94 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  30.14 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>