101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0171 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0171  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  100 
 
 
101 aa  202  1e-51  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  32.22 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.66 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.71 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.71 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  31.91 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  33.8 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.66 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  33.73 
 
 
121 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.58 
 
 
99 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  28.26 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  25.77 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  35.63 
 
 
121 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0363  flagellar hook-basal body protein FliE  32.93 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  25.88 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.88 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  38.03 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  38.03 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  34.57 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  36.62 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  36.62 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1181  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.11 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  31.91 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1067  flagellar hook-basal body protein FliE  35.71 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  29.87 
 
 
120 aa  47.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.21 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.62 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.87 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.94 
 
 
102 aa  47.4  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.73 
 
 
108 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1954  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36 
 
 
107 aa  47  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0630  flagellar hook-basal body protein FliE  31.58 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.632704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  27.78 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  36 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0551  flagellar hook-basal body protein FliE  31.58 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.51 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  36 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.58 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.07 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  36.11 
 
 
108 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.58 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.5 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3956  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.21 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  38.1 
 
 
118 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  35.63 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1323  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.98 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  30.59 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  36.62 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.57 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  31.17 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  32.94 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0298  flagellar hook-basal body protein FliE  32.32 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  34.88 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.94 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.76 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.39 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1643  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.8 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00083398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.76 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0268  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.25 
 
 
103 aa  43.5  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  25.25 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  32 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  31.82 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.17 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1157  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.67 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163223 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.43 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  33.8 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  25.27 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 
109 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  31.43 
 
 
98 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  32.39 
 
 
104 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1281  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.38 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0056  flagellar hook-basal body protein FliE  31.46 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.167472  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2946  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.11 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  36 
 
 
115 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1348  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.38 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.612995  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  30.88 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  29.7 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.12 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1653  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  35.44 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.117706  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.67 
 
 
110 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  33.75 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  29.7 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02890  Flagellar hook-basal body protein  23.58 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  29.7 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  29.7 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.67 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  32.89 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32 
 
 
113 aa  40.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.72 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  23.81 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 
104 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  34.72 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>