61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2348 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2348  flagellar hook-basal body complex protein FliE  100 
 
 		 105 aa  204  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  61.9 
 
 		 145 aa  94.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.15 
 
 		 110 aa  90.9  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  56 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0979  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.18 
 
 		 109 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.261482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  51.85 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0840  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.86 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2992  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  50 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  36.56 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  32.63 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  34.33 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.53 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.82 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  29.81 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.22 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2718  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.14 
 
 		 106 aa  50.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  30.14 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  30.1 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  37.93 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.33 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.06 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  25 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.06 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.23 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.53 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2233  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.42 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.05 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2667  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.89 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.32 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  30.88 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  27.37 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2636  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.96 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  33.33 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2606  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.96 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.205425  normal  0.349291 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.36 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2829  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.96 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135166  normal  0.230813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.77 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0655  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.86 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.642815  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  27.63 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.84 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.84 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.07 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  30.88 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2270  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.37 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  28.26 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1404  flagellar hook-basal body protein FliE  28.57 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.216787  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.84 
 
 		 110 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0704  flagellar hook-basal body protein FliE  31.51 
 
 		 95 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2963  flagellar hook-basal body protein FliE  42.31 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.238694 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1394  flagellar hook-basal body protein FliE  34 
 
 		 103 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.190515  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1672  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.72 
 
 		 98 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0551  flagellar hook-basal body protein FliE  28.57 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.87 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0630  flagellar hook-basal body protein FliE  28.57 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.632704  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1067  flagellar hook-basal body protein FliE  29.17 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0268  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  33.75 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  27.66 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  26.92 
 
 		 102 aa  40  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  31.94 
 
 		 98 aa  40  0.01  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>