More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2253 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2131  major facilitator transporter  99.81 
 
 		 529 aa  1036    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.025245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2253  major facilitator transporter  100 
 
 		 546 aa  1075    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2142  major facilitator transporter  99.82 
 
 		 546 aa  1072    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1504  major facilitator superfamily MFS_1  54.14 
 
 		 535 aa  523  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6606  major facilitator superfamily MFS_1  29.7 
 
 		 552 aa  193  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5554  major facilitator transporter  30.13 
 
 		 550 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0876  major facilitator superfamily MFS_1  27.92 
 
 		 532 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.757243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3786  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 560 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal  0.51855 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2415  transmembrane efflux protein  26.99 
 
 		 525 aa  167  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0516  major facilitator superfamily MFS_1  23.65 
 
 		 512 aa  145  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3967  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 535 aa  144  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.52 
 
 		 493 aa  114  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.49 
 
 		 541 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.88 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.98 
 
 		 532 aa  109  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.38 
 
 		 551 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.07 
 
 		 534 aa  105  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.98 
 
 		 524 aa  105  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.77 
 
 		 539 aa  104  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.36 
 
 		 788 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.12 
 
 		 527 aa  103  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.64 
 
 		 540 aa  103  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.35 
 
 		 514 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.6 
 
 		 505 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.6 
 
 		 512 aa  102  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 528 aa  103  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.8 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.42 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.16 
 
 		 509 aa  101  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.73 
 
 		 478 aa  100  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.24 
 
 		 504 aa  100  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 509 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.95 
 
 		 509 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 521 aa  97.8  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 517 aa  97.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  28.4 
 
 		 458 aa  97.1  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.81 
 
 		 487 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 518 aa  96.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  25.58 
 
 		 514 aa  96.7  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.42 
 
 		 511 aa  96.3  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  25.15 
 
 		 467 aa  95.5  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 540 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.47 
 
 		 498 aa  95.1  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  22.93 
 
 		 529 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 526 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  25.81 
 
 		 508 aa  94.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  25.24 
 
 		 497 aa  94  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2069  major facilitator superfamily permease  24 
 
 		 440 aa  93.6  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  24.04 
 
 		 562 aa  93.2  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2181  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.15 
 
 		 480 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272087  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  26.29 
 
 		 588 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  23.5 
 
 		 530 aa  91.3  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 516 aa  90.1  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.45 
 
 		 452 aa  89  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.15 
 
 		 478 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.37 
 
 		 486 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.37 
 
 		 486 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.37 
 
 		 486 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.99 
 
 		 478 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  25.53 
 
 		 480 aa  88.2  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.37 
 
 		 486 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.37 
 
 		 486 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.37 
 
 		 486 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 		 541 aa  87.8  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30480  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.33 
 
 		 559 aa  87.4  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.52 
 
 		 494 aa  87.4  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 528 aa  87.4  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2404  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.94 
 
 		 480 aa  87  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0469285  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  25.95 
 
 		 503 aa  87.4  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0693  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 472 aa  87  8e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 508 aa  87  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2474  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.82 
 
 		 480 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27.56 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  25.06 
 
 		 480 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  20.73 
 
 		 522 aa  85.1  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2339  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.26 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2986  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.76 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.24 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2149  drug resistance transporter  25.24 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.24 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17640  arabinose efflux permease family protein  27.27 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00798573  normal  0.929422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.18 
 
 		 484 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2392  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.24 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 524 aa  84.7  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 516 aa  84.7  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  27.72 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2701  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 503 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417248  normal  0.482514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  23 
 
 		 553 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 		 490 aa  83.6  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  28.19 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.69 
 
 		 478 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  26.48 
 
 		 517 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.47 
 
 		 583 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.38 
 
 		 627 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.48 
 
 		 609 aa  82.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  26.17 
 
 		 539 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3272  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.75 
 
 		 469 aa  82.8  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965084  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 506 aa  82  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>