More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0516 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0516  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
512 aa  1016    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2415  transmembrane efflux protein  34.04 
 
 
525 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0876  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 
532 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.757243  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5554  major facilitator transporter  33.61 
 
 
550 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.68 
 
 
541 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3786  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 
560 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal  0.51855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6606  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 
552 aa  216  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.41 
 
 
551 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.66 
 
 
551 aa  194  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.3 
 
 
478 aa  183  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.93 
 
 
522 aa  181  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 
484 aa  179  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.82 
 
 
478 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.6 
 
 
502 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.45 
 
 
486 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.45 
 
 
486 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.45 
 
 
486 aa  177  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.08 
 
 
532 aa  177  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.93 
 
 
534 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371671  normal  0.0821497 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 
486 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 
486 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.21 
 
 
486 aa  176  9e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.22 
 
 
539 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.3 
 
 
452 aa  169  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.01 
 
 
478 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3316  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.64 
 
 
550 aa  163  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0200557  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.44 
 
 
458 aa  160  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.24 
 
 
478 aa  160  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.05 
 
 
534 aa  157  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.97 
 
 
487 aa  157  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.95 
 
 
488 aa  156  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.89 
 
 
489 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.88 
 
 
469 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.47 
 
 
627 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.38 
 
 
485 aa  153  7e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.48 
 
 
496 aa  153  8e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 
527 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.68 
 
 
487 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 
483 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2142  major facilitator transporter  23.66 
 
 
546 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.3 
 
 
466 aa  152  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.27 
 
 
498 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0759  major facilitator superfamily permease  31.14 
 
 
554 aa  151  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000977825  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2253  major facilitator transporter  24.1 
 
 
546 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.89 
 
 
609 aa  151  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.33 
 
 
510 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5751  major facilitator transporter  28.88 
 
 
486 aa  150  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.04 
 
 
546 aa  150  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.88 
 
 
522 aa  150  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.78 
 
 
527 aa  150  7e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.39 
 
 
505 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.37 
 
 
540 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.76 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.34 
 
 
493 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2131  major facilitator transporter  24.07 
 
 
529 aa  148  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.025245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  26.79 
 
 
497 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.41 
 
 
646 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.41 
 
 
646 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2796  major facilitator superfamily protein  29.79 
 
 
493 aa  147  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.252662  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  28.44 
 
 
480 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.16 
 
 
646 aa  147  6e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.41 
 
 
504 aa  146  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.2 
 
 
511 aa  145  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  24.14 
 
 
516 aa  145  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4895  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26 
 
 
471 aa  145  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00145217  hitchhiker  0.000000911862 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.81 
 
 
489 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4166  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  27.42 
 
 
475 aa  144  3e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000209718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5189  drug resistance MFS transporter, drug:H+ antiporter-1 (DHA2) family  27.65 
 
 
475 aa  144  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000921639  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03640  predicted multidrug or homocysteine efflux system  27.42 
 
 
475 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000334579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4213  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.42 
 
 
475 aa  143  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000513335  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4121  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.42 
 
 
475 aa  143  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00185105  normal  0.108904 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3973  DHA2 family drug:H+ antiporter-1  27.42 
 
 
475 aa  143  6e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028828  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2785  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.13 
 
 
500 aa  143  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03585  hypothetical protein  27.42 
 
 
475 aa  143  6e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000182084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 
502 aa  143  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2926  major facilitator transporter  25.26 
 
 
516 aa  143  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102472  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
492 aa  143  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  26.83 
 
 
500 aa  143  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.5 
 
 
521 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6497  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
630 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  27.59 
 
 
511 aa  142  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 
477 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.24 
 
 
478 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30480  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.12 
 
 
559 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.18 
 
 
509 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  27.15 
 
 
510 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.46 
 
 
487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4240  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.19 
 
 
475 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000183505  decreased coverage  0.00293146 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  25.95 
 
 
470 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  29.06 
 
 
503 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2027  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.32 
 
 
505 aa  140  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.585594  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1880  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.02 
 
 
501 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.096597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4110  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.63 
 
 
475 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00236277  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.68 
 
 
541 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.42 
 
 
583 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.18 
 
 
520 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0262  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.95 
 
 
500 aa  138  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0858399  decreased coverage  0.0004758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  26.35 
 
 
530 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4170  inner membrane transport protein YieO  26.57 
 
 
475 aa  138  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0309418  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>