More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1504 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1504  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 535 aa  1049    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2253  major facilitator transporter  54.14 
 
 		 546 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2142  major facilitator transporter  53.95 
 
 		 546 aa  555  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2131  major facilitator transporter  54.58 
 
 		 529 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.025245 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5554  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 550 aa  170  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3786  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 		 560 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal  0.51855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6606  major facilitator superfamily MFS_1  29.34 
 
 		 552 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2415  transmembrane efflux protein  27.61 
 
 		 525 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0876  major facilitator superfamily MFS_1  27.8 
 
 		 532 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.757243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0516  major facilitator superfamily MFS_1  23.12 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3967  major facilitator transporter  23.26 
 
 		 535 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  24.9 
 
 		 509 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  25.38 
 
 		 467 aa  92.4  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 481 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.29 
 
 		 541 aa  89.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2069  major facilitator superfamily permease  24.33 
 
 		 440 aa  89.7  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.17 
 
 		 540 aa  87.4  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.89 
 
 		 551 aa  87.4  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  24.89 
 
 		 508 aa  85.1  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.75 
 
 		 504 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.44 
 
 		 534 aa  81.3  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 524 aa  80.9  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.11 
 
 		 551 aa  78.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  25 
 
 		 526 aa  78.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  24.07 
 
 		 521 aa  78.6  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.32 
 
 		 757 aa  78.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.05 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4414  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.1 
 
 		 503 aa  78.6  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  23.15 
 
 		 483 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.94 
 
 		 534 aa  77.4  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.4 
 
 		 509 aa  77  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.67 
 
 		 512 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  24.3 
 
 		 528 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  22.66 
 
 		 516 aa  72.8  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.61 
 
 		 545 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.35 
 
 		 788 aa  72  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1077  major facilitator superfamily permease  23.95 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.61 
 
 		 524 aa  71.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.4 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3817  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.18 
 
 		 697 aa  71.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00137036  normal  0.060926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.02 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  24.24 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.78 
 
 		 646 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.78 
 
 		 646 aa  70.5  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 733 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.92 
 
 		 541 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0301  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.81 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.112532 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0782  multidrug resistance protein B  23.63 
 
 		 520 aa  68.9  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  24.65 
 
 		 497 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.95 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 516 aa  68.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.53 
 
 		 646 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  19.57 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0402  major facilitator superfamily protein  19.25 
 
 		 508 aa  67.8  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.537567  normal  0.124421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8279  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.69 
 
 		 680 aa  67.4  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270413  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  23.83 
 
 		 503 aa  67.4  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.97 
 
 		 452 aa  67  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 555 aa  67  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.83 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 503 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.75 
 
 		 532 aa  66.6  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  22.05 
 
 		 518 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.64 
 
 		 538 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.96 
 
 		 528 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1890  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.67 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  20.64 
 
 		 478 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  27.6 
 
 		 528 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4871  major facilitator superfamily MFS_1  23.79 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3261  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  24.76 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27524  normal  0.337797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.77 
 
 		 527 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0124  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.76 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.55159  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  23.91 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 525 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.63 
 
 		 539 aa  64.7  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2909  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  21.59 
 
 		 635 aa  64.7  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000610887  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  23.36 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2747  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.38 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4864  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.5 
 
 		 685 aa  64.3  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 588 aa  64.3  0.000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37347  suppressor of gal11 null  22.6 
 
 		 569 aa  63.9  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.315077 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.5 
 
 		 546 aa  63.9  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.56 
 
 		 682 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.56 
 
 		 682 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.56 
 
 		 682 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1065  major facilitator transporter  26.94 
 
 		 475 aa  63.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.44 
 
 		 487 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0848  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0901797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0907  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.87 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  24 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.38 
 
 		 541 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2440  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.4 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.51 
 
 		 525 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  21.44 
 
 		 579 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2488  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.4 
 
 		 479 aa  63.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2133  drug resistance transporter  24.7 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5419  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 462 aa  62  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.354137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>