More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3786 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3786  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
560 aa  1079    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398253  normal  0.51855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6606  major facilitator superfamily MFS_1  54.41 
 
 
552 aa  521  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5554  major facilitator transporter  54.21 
 
 
550 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.715262  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0876  major facilitator superfamily MFS_1  42.91 
 
 
532 aa  357  2.9999999999999997e-97  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.757243  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2415  transmembrane efflux protein  37.02 
 
 
525 aa  294  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0900515 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0516  major facilitator superfamily MFS_1  32.31 
 
 
512 aa  226  1e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2142  major facilitator transporter  26.14 
 
 
546 aa  184  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2253  major facilitator transporter  25.95 
 
 
546 aa  181  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2131  major facilitator transporter  25.95 
 
 
529 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.025245 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.02 
 
 
532 aa  179  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  29.61 
 
 
470 aa  168  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000700007 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3967  major facilitator transporter  26.25 
 
 
535 aa  169  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.96 
 
 
522 aa  163  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7831  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.91 
 
 
502 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0429863 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.14 
 
 
532 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  30.67 
 
 
490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.59 
 
 
505 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.79 
 
 
522 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0847  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.96 
 
 
551 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.182746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0484  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.45 
 
 
551 aa  152  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 
478 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.51 
 
 
512 aa  151  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.11 
 
 
508 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  29.91 
 
 
483 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.47 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  29.68 
 
 
519 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.32 
 
 
521 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.86 
 
 
524 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.3 
 
 
452 aa  148  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1504  major facilitator superfamily MFS_1  28.08 
 
 
535 aa  147  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.74 
 
 
540 aa  146  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2303  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 
518 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.17 
 
 
539 aa  146  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.38 
 
 
504 aa  144  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 
520 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.93 
 
 
485 aa  142  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  29.05 
 
 
497 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  27 
 
 
522 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.27 
 
 
528 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  29 
 
 
481 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.19 
 
 
489 aa  141  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 
487 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.19 
 
 
541 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.85 
 
 
458 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0759  major facilitator superfamily permease  26.48 
 
 
554 aa  139  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000977825  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4798  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.53 
 
 
518 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  27.63 
 
 
467 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.85 
 
 
488 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.48 
 
 
520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  27.83 
 
 
530 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.07 
 
 
520 aa  137  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.15 
 
 
579 aa  137  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  27.75 
 
 
491 aa  137  7.000000000000001e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.37 
 
 
504 aa  137  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.27 
 
 
493 aa  136  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 
463 aa  136  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.82 
 
 
502 aa  136  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.36 
 
 
607 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7431  major facilitator superfamily MFS_1  28.96 
 
 
533 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  30.86 
 
 
475 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.38 
 
 
646 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 
507 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.54 
 
 
646 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.91 
 
 
468 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.54 
 
 
646 aa  135  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.49 
 
 
583 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6356  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.19 
 
 
492 aa  134  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.92 
 
 
487 aa  134  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0856  major facilitator superfamily MFS_1  27.33 
 
 
471 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.54 
 
 
486 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.04243 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  28.6 
 
 
511 aa  133  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.44 
 
 
546 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3316  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.66 
 
 
550 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0200557  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.66 
 
 
763 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.85 
 
 
558 aa  131  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  30.36 
 
 
503 aa  131  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.01 
 
 
487 aa  131  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.28 
 
 
509 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.76 
 
 
609 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2069  major facilitator superfamily permease  26.81 
 
 
440 aa  130  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.35 
 
 
505 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2597  major facilitator transporter  29.79 
 
 
509 aa  130  7.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0332017  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.57 
 
 
480 aa  130  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.14 
 
 
525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7777  transporter  27.4 
 
 
480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.16 
 
 
519 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.23 
 
 
487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4634  major facilitator transporter  28.51 
 
 
471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  27.31 
 
 
516 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.74 
 
 
510 aa  129  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 
480 aa  128  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.38 
 
 
545 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  27.7 
 
 
483 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.39 
 
 
474 aa  127  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.11 
 
 
502 aa  127  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30480  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.61 
 
 
559 aa  127  7e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2459  major facilitator superfamily MFS_1  30.57 
 
 
516 aa  126  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.16 
 
 
520 aa  127  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.48 
 
 
478 aa  127  8.000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.24 
 
 
527 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>