More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0770 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
255 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6091  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.92 
 
 
260 aa  320  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50583  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54 
 
 
253 aa  248  6e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00235361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2035  putative gluconate 5-dehydrogenase  51.78 
 
 
254 aa  222  4e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0913776  normal  0.102555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6803  hypothetical protein  45.85 
 
 
259 aa  218  7e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  48.18 
 
 
254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.06 
 
 
262 aa  198  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.77 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3576  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.1 
 
 
257 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000680094  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2437  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44 
 
 
255 aa  193  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 
257 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.099673  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  42.74 
 
 
255 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2562  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.22 
 
 
251 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00521448  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.7 
 
 
258 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.063344  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
257 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  44.4 
 
 
258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 
265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  39.84 
 
 
254 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.57 
 
 
255 aa  181  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  42 
 
 
257 aa  180  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.34 
 
 
272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5032  gluconate 5-dehydrogenase  44.58 
 
 
252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  39.44 
 
 
254 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31400  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  46.9 
 
 
260 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308782  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0777  gluconate 5-dehydrogenase  44 
 
 
251 aa  178  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618291  hitchhiker  0.00200145 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.76 
 
 
257 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
254 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.15 
 
 
258 aa  175  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.58 
 
 
261 aa  175  6e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  40.73 
 
 
256 aa  175  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.4 
 
 
269 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.32 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.73 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  40.62 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_11192  predicted protein  52.98 
 
 
172 aa  172  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.709785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  40.23 
 
 
260 aa  172  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.57 
 
 
255 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2567  gluconate 5-dehydrogenase  41.86 
 
 
267 aa  171  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0700463  normal  0.82906 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1763  gluconate 5-dehydrogenase  40.62 
 
 
260 aa  170  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.401808  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3987  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
261 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745234  normal  0.0404538 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
257 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
257 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1844  gluconate 5-dehydrogenase  42.19 
 
 
263 aa  169  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.250447  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0349  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  40.32 
 
 
257 aa  169  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  38.89 
 
 
254 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5798  gluconate 5-dehydrogenase  43.43 
 
 
251 aa  169  6e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475551  hitchhiker  0.00243591 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  42.05 
 
 
260 aa  168  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2919  gluconate 5-dehydrogenase  40.39 
 
 
264 aa  168  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2403  gluconate 5-dehydrogenase  41.31 
 
 
258 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.525317  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2493  gluconate 5-dehydrogenase  41.86 
 
 
274 aa  167  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  41.67 
 
 
260 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1164  gluconate 5-dehydrogenase  37.84 
 
 
263 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2873  gluconate 5-dehydrogenase  40.71 
 
 
263 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2353  gluconate 5-dehydrogenase  41.18 
 
 
262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
264 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  38.49 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0265  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.34 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.534726  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42 
 
 
256 aa  162  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000516058  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3003  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
257 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.605713  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2306  gluconate 5-dehydrogenase  42.46 
 
 
262 aa  161  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4263  gluconate 5-dehydrogenase  35.43 
 
 
263 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
260 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0593655  normal  0.256231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0620  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.56 
 
 
255 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.58504  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 
261 aa  160  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.385793 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0922  Short-chain alcohol dehydrogenase  35.16 
 
 
256 aa  160  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000799282  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0669  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.65 
 
 
259 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0399726  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0118  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.47 
 
 
256 aa  160  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0380  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.04 
 
 
266 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.74 
 
 
251 aa  159  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07750  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  35.94 
 
 
252 aa  159  5e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.370743 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1283  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  37.05 
 
 
258 aa  159  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000166105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1802  gluconate 5-dehydrogenase  34.24 
 
 
260 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.87 
 
 
254 aa  158  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.203579  normal  0.799434 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2008  gluconate 5-dehydrogenase  42.91 
 
 
263 aa  158  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.30693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1695  gluconate 5-dehydrogenase  42.91 
 
 
263 aa  158  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.443892 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0392  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.46 
 
 
258 aa  158  8e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.11 
 
 
254 aa  158  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0396  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.46 
 
 
258 aa  158  9e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.22 
 
 
259 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0277  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  41.43 
 
 
251 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1769  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.68 
 
 
245 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0946  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
255 aa  156  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245481  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1671  Short-chain alcohol dehydrogenase  34.94 
 
 
260 aa  156  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.321944  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3035  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  42.29 
 
 
251 aa  155  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.810122 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.8 
 
 
247 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000108862  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
254 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0416  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  39.36 
 
 
245 aa  155  7e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.05 
 
 
255 aa  155  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2747  gluconate 5-dehydrogenase  46.03 
 
 
253 aa  155  8e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0157  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.37 
 
 
257 aa  155  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000174096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1716  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38 
 
 
253 aa  154  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3515  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.39 
 
 
255 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  36.47 
 
 
262 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4004  gluconate 5-dehydrogenase  40.62 
 
 
267 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 
253 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2231  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.11 
 
 
257 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000702714  hitchhiker  0.00000000852913 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>