More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31400 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_31400  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  100 
 
 
260 aa  508  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.308782  normal  0.144214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6803  hypothetical protein  67.44 
 
 
259 aa  318  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.992711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.88 
 
 
262 aa  246  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.09 
 
 
257 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.099673  normal  0.25905 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6091  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.4 
 
 
260 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50583  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2035  putative gluconate 5-dehydrogenase  45.28 
 
 
254 aa  184  9e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0913776  normal  0.102555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1688  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.29 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.205541  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0770  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.9 
 
 
255 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.19 
 
 
253 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00235361 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 
251 aa  169  3e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3725  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
269 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725023  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  35.16 
 
 
254 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.29 
 
 
257 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.600374  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4309  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
257 aa  166  5e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.313012  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2971  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 
257 aa  165  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3213  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 
254 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4511  gluconate 5-dehydrogenase  35.16 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0349  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.68 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202503  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.844576  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0158  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0641  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2979  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
257 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000666637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3204  short chain dehydrogenase  37.45 
 
 
257 aa  162  7e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00024474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
257 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46750  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
257 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.658343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
254 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3288  gluconate 5-dehydrogenase  37.11 
 
 
254 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.978364  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.53 
 
 
257 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2927  short chain dehydrogenase  37.94 
 
 
254 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1751  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
257 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0168825 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
255 aa  159  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2389  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.74 
 
 
255 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2906  short chain dehydrogenase  36.68 
 
 
257 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.01573  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2043  short chain dehydrogenase  37.4 
 
 
254 aa  158  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.179832  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0236  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.8 
 
 
255 aa  158  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00815339 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  35.43 
 
 
257 aa  157  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7068  SDR family dehydrogenase/reductase  38.74 
 
 
257 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2160  Short-chain dehydrogenase/reductase  40.78 
 
 
254 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
261 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.718128 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.78 
 
 
254 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.26 
 
 
259 aa  156  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.66 
 
 
256 aa  155  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.936397  normal  0.224474 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3195  short chain dehydrogenase  37.5 
 
 
254 aa  156  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.961383  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2862  short chain dehydrogenase  36.15 
 
 
255 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7084  gluconate 5-dehydrogenase  35.43 
 
 
255 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0465  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6198  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
260 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2136  gluconate 5-dehydrogenase  35.77 
 
 
256 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.510387  normal  0.0477177 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2206  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.6 
 
 
254 aa  151  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0824665  hitchhiker  0.00853535 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1273  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.51 
 
 
257 aa  150  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.355177  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2043  short chain dehydrogenase  37.36 
 
 
254 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
254 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.487626 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2006  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.15 
 
 
265 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.243411  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
253 aa  149  4e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0335723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.9 
 
 
263 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
272 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.382394  normal  0.103507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0468  gluconate 5-dehydrogenase  40.15 
 
 
251 aa  148  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175213  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3895  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  38.28 
 
 
248 aa  148  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.589012  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.58 
 
 
255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.28 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2646  phosphatidylserine decarboxylase  34.92 
 
 
258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.229989  normal  0.216925 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01160  LSDR, putative  35.04 
 
 
293 aa  146  3e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1409  gluconate 5-dehydrogenase  38.31 
 
 
260 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5878  gluconate 5-dehydrogenase  40.55 
 
 
259 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.854497  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4436  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
265 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
256 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  36.61 
 
 
258 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  33.2 
 
 
267 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0537  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.08 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9124  gluconate 5-dehydrogenase  34.77 
 
 
256 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.991877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3404  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
257 aa  145  9e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4887  gluconate 5-dehydrogenase  34.12 
 
 
254 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.851377  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5273  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.85 
 
 
260 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000251333 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2618  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
255 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2264  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
255 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136651  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.02 
 
 
254 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0672528  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0232  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.25 
 
 
251 aa  144  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1443  gluconate 5-dehydrogenase  36.26 
 
 
260 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325951  normal  0.0253033 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0118  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  33.2 
 
 
256 aa  143  3e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0498  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  40.78 
 
 
252 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.726139  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1971  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  36.11 
 
 
253 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3478  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.19 
 
 
255 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2032  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.71 
 
 
253 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  33.2 
 
 
262 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2747  gluconate 5-dehydrogenase  42.97 
 
 
253 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 
255 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.24294  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2692  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
272 aa  142  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.108602 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1851  gluconate 5-dehydrogenase  37.93 
 
 
260 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.198252 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4868  gluconate 5-dehydrogenase  34.12 
 
 
254 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.113188 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2202  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.71 
 
 
253 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0773662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
252 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0949  gluconate 5-dehydrogenase  33.59 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000161447 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1484  gluconate 5-dehydrogenase  35.5 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0155973  normal  0.0417322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3509  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
255 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2643  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.32 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.802213  normal  0.105966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1693  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.32 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.523034  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1803  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  35.32 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.711857  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1433  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>