More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0611 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0611  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  606  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.22 
 
 		 327 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  35.59 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.8 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  36.96 
 
 		 339 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  38.36 
 
 		 337 aa  197  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  37.71 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  37.59 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  36.7 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  37.21 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  37.21 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  36.07 
 
 		 328 aa  195  8.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  38.33 
 
 		 327 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3868  hypothetical protein  34.67 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.231863  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  35.76 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  37.92 
 
 		 345 aa  192  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  37.92 
 
 		 345 aa  192  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  37.54 
 
 		 327 aa  192  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.7 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5531  hypothetical protein  35.12 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  36.75 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  36.7 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  36.49 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  36.33 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  37.04 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  35.92 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  38.81 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  34.67 
 
 		 337 aa  189  4e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  35.43 
 
 		 334 aa  189  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  35.53 
 
 		 304 aa  188  8e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  36.82 
 
 		 349 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  35.69 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  35.53 
 
 		 343 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  36.65 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  35.43 
 
 		 331 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  36.03 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3258  hypothetical protein  37.62 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0738365  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  38.81 
 
 		 360 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.86 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  34.68 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  35.64 
 
 		 328 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  35.69 
 
 		 326 aa  185  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2932  hypothetical protein  35.45 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.474925  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  35.2 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4497  twin-arginine translocation pathway signal  35.45 
 
 		 322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4401  hypothetical protein  36.61 
 
 		 321 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0268815  normal  0.198915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  38.78 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1334  hypothetical protein  36.42 
 
 		 325 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000781341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  37.04 
 
 		 335 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5776  hypothetical protein  37.81 
 
 		 329 aa  182  7e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138477 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4142  hypothetical protein  33.22 
 
 		 328 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  33.45 
 
 		 327 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  36.18 
 
 		 325 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  33.78 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  34.93 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  35.1 
 
 		 318 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  35.18 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  36.72 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2999  hypothetical protein  34.01 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.272534 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5199  hypothetical protein  34.46 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  34.32 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2931  hypothetical protein  34.12 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  36.96 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6030  hypothetical protein  36.03 
 
 		 351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.053883  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  34.46 
 
 		 325 aa  179  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  37.92 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0485  hypothetical protein  36.76 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  35.34 
 
 		 349 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  36.33 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  32.89 
 
 		 330 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  35.71 
 
 		 326 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  34.27 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  34.12 
 
 		 325 aa  179  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4625  hypothetical protein  34.15 
 
 		 327 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  34.95 
 
 		 328 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  34.98 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  34.98 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  33.77 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0208  hypothetical protein  35.93 
 
 		 335 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  35.56 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  34.11 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0712  hypothetical protein  34.11 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.780507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  35.23 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1604  hypothetical protein  37.92 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  34.95 
 
 		 328 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  33.11 
 
 		 333 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  37.16 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  33.33 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1562  hypothetical protein  32.32 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000177519 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  34.38 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5932  hypothetical protein  33.22 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3371  hypothetical protein  35.79 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  34.53 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3987  hypothetical protein  35.23 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.700334  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4969  extra-cytoplasmic solute receptor  36.82 
 
 		 364 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.332662  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  34.12 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  33.89 
 
 		 322 aa  175  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  34.58 
 
 		 325 aa  175  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  31.99 
 
 		 328 aa  175  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4265  hypothetical protein  33.33 
 
 		 328 aa  175  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.348047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>