More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05127 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05127  protease II  100 
 
 		 670 aa  1388    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001256  protease II  67.16 
 
 		 665 aa  962    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0075  protease II  43.64 
 
 		 665 aa  551  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000167862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  32.58 
 
 		 711 aa  338  9.999999999999999e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  32.18 
 
 		 683 aa  317  4e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  32.18 
 
 		 683 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  32.18 
 
 		 683 aa  317  4e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  31.58 
 
 		 686 aa  317  5e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  31.93 
 
 		 683 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  31.37 
 
 		 697 aa  309  1.0000000000000001e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  31.52 
 
 		 677 aa  308  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  31.01 
 
 		 686 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  31.01 
 
 		 686 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  30.86 
 
 		 686 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  30.86 
 
 		 686 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  30.86 
 
 		 686 aa  304  4.0000000000000003e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  30.87 
 
 		 691 aa  303  5.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  30.86 
 
 		 686 aa  303  5.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  30.57 
 
 		 683 aa  303  8.000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  30.56 
 
 		 686 aa  303  9e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  30.41 
 
 		 686 aa  301  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  32.03 
 
 		 729 aa  297  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  30.17 
 
 		 711 aa  294  3e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  30.42 
 
 		 696 aa  291  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  31.33 
 
 		 705 aa  291  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  31.47 
 
 		 703 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  30.42 
 
 		 682 aa  287  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  29.53 
 
 		 683 aa  287  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  30.28 
 
 		 696 aa  286  5.999999999999999e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  32.05 
 
 		 711 aa  286  9e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  29.91 
 
 		 683 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  29.91 
 
 		 683 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  29.91 
 
 		 683 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  29.91 
 
 		 683 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  29.91 
 
 		 683 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  31.85 
 
 		 711 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  31.9 
 
 		 711 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  31.85 
 
 		 711 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  30.38 
 
 		 686 aa  283  8.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  29.71 
 
 		 704 aa  281  3e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  29.11 
 
 		 686 aa  279  1e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  28.92 
 
 		 725 aa  278  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  31.13 
 
 		 703 aa  278  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  30.65 
 
 		 716 aa  277  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  28.66 
 
 		 721 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  30 
 
 		 697 aa  271  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  29.63 
 
 		 686 aa  270  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  31.09 
 
 		 696 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  31.23 
 
 		 705 aa  270  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  30.55 
 
 		 708 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  29.66 
 
 		 711 aa  267  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  32.28 
 
 		 695 aa  266  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  30.66 
 
 		 717 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  29.38 
 
 		 711 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  32.9 
 
 		 709 aa  264  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  29.63 
 
 		 686 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  29.66 
 
 		 711 aa  263  6e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  29.79 
 
 		 713 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  29.23 
 
 		 711 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  29.6 
 
 		 682 aa  261  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  29.08 
 
 		 700 aa  259  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1464  oligopeptidase B  28.46 
 
 		 693 aa  259  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  28.55 
 
 		 722 aa  259  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  28.94 
 
 		 698 aa  258  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  29.51 
 
 		 688 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  32.78 
 
 		 680 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  28.89 
 
 		 678 aa  255  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3297  Oligopeptidase B  30.36 
 
 		 695 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.501121  normal  0.104616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  29.39 
 
 		 680 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  29.54 
 
 		 680 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  28.89 
 
 		 700 aa  253  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  30.32 
 
 		 686 aa  253  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  29.02 
 
 		 684 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  28.85 
 
 		 699 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  27.29 
 
 		 719 aa  252  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  30 
 
 		 710 aa  252  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  28.72 
 
 		 696 aa  251  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  28.97 
 
 		 685 aa  251  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  26.78 
 
 		 678 aa  251  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  29.57 
 
 		 685 aa  251  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  29.81 
 
 		 690 aa  251  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  28.45 
 
 		 715 aa  249  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  29.21 
 
 		 690 aa  248  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  29.38 
 
 		 701 aa  248  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  28.25 
 
 		 688 aa  247  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  29.73 
 
 		 710 aa  246  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  28.34 
 
 		 680 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  28.87 
 
 		 702 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  29.82 
 
 		 683 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  27.84 
 
 		 671 aa  243  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  28.89 
 
 		 702 aa  243  7.999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24161  predicted protein  28.53 
 
 		 812 aa  243  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.314931  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  28.89 
 
 		 702 aa  243  1e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  28.3 
 
 		 702 aa  242  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  28.59 
 
 		 701 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  28.78 
 
 		 702 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  29.44 
 
 		 678 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  31.68 
 
 		 683 aa  241  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  28.57 
 
 		 739 aa  240  6.999999999999999e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  28.17 
 
 		 711 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>