111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001873 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  100 
 
 		 626 aa  1282    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  83.57 
 
 		 627 aa  1075    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  39.29 
 
 		 222 aa  88.2  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  35.66 
 
 		 251 aa  87  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  34.44 
 
 		 274 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  33.77 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  34.33 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  33.58 
 
 		 247 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  33.58 
 
 		 247 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  34.33 
 
 		 273 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  33.58 
 
 		 247 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  35.2 
 
 		 227 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  28.78 
 
 		 167 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  31.85 
 
 		 256 aa  79.7  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  35.56 
 
 		 248 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  34.71 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  33.9 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  35.19 
 
 		 178 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  35.19 
 
 		 184 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  31.9 
 
 		 225 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  34.78 
 
 		 167 aa  75.9  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 245 aa  75.1  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  33.61 
 
 		 178 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  35.19 
 
 		 178 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  35.59 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  36.92 
 
 		 174 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  31.91 
 
 		 167 aa  73.9  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  31.34 
 
 		 239 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1956  hypothetical protein  35.11 
 
 		 289 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221444  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  32.85 
 
 		 308 aa  73.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  30 
 
 		 167 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  35.38 
 
 		 174 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  30.5 
 
 		 248 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  29.77 
 
 		 166 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  30.37 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  29.69 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  28.46 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  33.86 
 
 		 234 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  32.09 
 
 		 179 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  32.09 
 
 		 177 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  29.01 
 
 		 166 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  30.28 
 
 		 266 aa  69.3  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  33.08 
 
 		 169 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2473  hypothetical protein  34.75 
 
 		 291 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  33.88 
 
 		 181 aa  68.2  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  33.06 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  33.64 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  32.03 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  28.46 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  32.77 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  28.46 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2219  hypothetical protein  22.94 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0902301  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  33.64 
 
 		 183 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2273  hypothetical protein  27.07 
 
 		 316 aa  65.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047797  n/a   
 
 
 
NC_008345  Sfri_2188  hypothetical protein  30.37 
 
 		 256 aa  66.2  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2064  hypothetical protein  31.75 
 
 		 289 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0026  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1093  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1631  hypothetical protein  27.15 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  29.1 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1639  hypothetical protein  22.42 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0464228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1564  hypothetical protein  22.82 
 
 		 321 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2601  hypothetical protein  32.56 
 
 		 289 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1706  hypothetical protein  31.36 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604018  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  62.4  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  32.12 
 
 		 182 aa  62  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  30.47 
 
 		 148 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  27.34 
 
 		 268 aa  62  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  28.04 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0084  hypothetical protein  31.97 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  28.06 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  26.83 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  30.56 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  30.83 
 
 		 172 aa  59.7  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  30.67 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  34.31 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  26.09 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  28.93 
 
 		 151 aa  57  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0613  protein of unknown function DUF785  31.3 
 
 		 146 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.583928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  26.77 
 
 		 458 aa  53.9  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3666  hypothetical protein  26.67 
 
 		 141 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  29.27 
 
 		 179 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  29.27 
 
 		 179 aa  52  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  29.57 
 
 		 153 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  29.57 
 
 		 153 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  28.46 
 
 		 206 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  25.98 
 
 		 157 aa  50.8  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  28.46 
 
 		 179 aa  50.4  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  31.31 
 
 		 160 aa  50.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6088  protein of unknown function DUF785  24.49 
 
 		 162 aa  50.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  31.71 
 
 		 159 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  28.03 
 
 		 166 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  25.4 
 
 		 149 aa  48.9  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  29.41 
 
 		 144 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2265  hypothetical protein  24.35 
 
 		 161 aa  48.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  24.48 
 
 		 142 aa  47.8  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2978  hypothetical protein  38.46 
 
 		 133 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148956  normal  0.0419539 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  24.81 
 
 		 471 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  25.64 
 
 		 149 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>