117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2083 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  360  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  95.09 
 
 		 183 aa  318  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  75.84 
 
 		 178 aa  281  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  75.84 
 
 		 178 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  70.95 
 
 		 179 aa  260  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  69.66 
 
 		 178 aa  259  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  71.68 
 
 		 177 aa  258  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  77.22 
 
 		 178 aa  255  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  77.85 
 
 		 178 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  77.85 
 
 		 184 aa  253  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  69.51 
 
 		 178 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  51.22 
 
 		 169 aa  167  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  51.3 
 
 		 234 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  52.32 
 
 		 166 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  52.32 
 
 		 166 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  53.29 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  51.66 
 
 		 166 aa  158  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  51.32 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  49.67 
 
 		 167 aa  150  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  47.71 
 
 		 167 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  45.73 
 
 		 170 aa  141  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  38.85 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0099  hypothetical protein  36.14 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  37.58 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0084  hypothetical protein  36.14 
 
 		 175 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  34.67 
 
 		 267 aa  92.4  3e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  37.5 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  38.56 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  35.14 
 
 		 247 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  35.14 
 
 		 247 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  35.14 
 
 		 247 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  35.37 
 
 		 277 aa  86.7  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  35.14 
 
 		 247 aa  86.3  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  36.49 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  37.25 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  35.14 
 
 		 274 aa  85.5  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  33.52 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  37.84 
 
 		 159 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  35.81 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  32.28 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  35.57 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  34.46 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  36.3 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  35.81 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2188  hypothetical protein  34.46 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305325  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  34.01 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  33.78 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  32.45 
 
 		 222 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  36.49 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  32.47 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  34.44 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  32.87 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  33.56 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  37.1 
 
 		 248 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  31.94 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  34.25 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  31.79 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  33.59 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  32.43 
 
 		 248 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  36.59 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  32.41 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  31.72 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  37.1 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  33.74 
 
 		 458 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  30.61 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  30.77 
 
 		 245 aa  74.3  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  37.06 
 
 		 149 aa  73.6  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  30.26 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  35.51 
 
 		 627 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  32.88 
 
 		 149 aa  72  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  34.87 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  35.37 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  31.08 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  32.41 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  28.09 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  33.64 
 
 		 626 aa  67.8  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23190  hypothetical protein  31.13 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  34.04 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  31.69 
 
 		 142 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2354  hypothetical protein  30.26 
 
 		 163 aa  67  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00335238  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2309  hypothetical protein  30.61 
 
 		 152 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  30.67 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  30.2 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  30.41 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  29.17 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0613  protein of unknown function DUF785  35.14 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.583928 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  30.72 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  31.51 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  32.24 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  31.94 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  31.69 
 
 		 459 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  32.79 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  30.34 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1211  hypothetical protein  31.94 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  33.33 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  33.33 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  29.3 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  29.58 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0129341 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>