115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1956 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1956  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  591  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221444  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2219  hypothetical protein  62.54 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0902301  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2473  hypothetical protein  64.96 
 
 		 291 aa  362  4e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2601  hypothetical protein  61.05 
 
 		 289 aa  359  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1639  hypothetical protein  61.19 
 
 		 321 aa  350  2e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0464228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1631  hypothetical protein  60 
 
 		 321 aa  350  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1564  hypothetical protein  60.97 
 
 		 321 aa  349  3e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2064  hypothetical protein  60.35 
 
 		 289 aa  349  3e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1706  hypothetical protein  53.77 
 
 		 294 aa  314  8e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604018  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2273  hypothetical protein  52.05 
 
 		 316 aa  299  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047797  n/a   
 
 
 
NC_011313  VSAL_II0026  hypothetical protein  49.65 
 
 		 165 aa  132  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1093  hypothetical protein  49.65 
 
 		 165 aa  132  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  35.11 
 
 		 626 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  31.3 
 
 		 627 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  30.58 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  32.88 
 
 		 459 aa  62.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  32.14 
 
 		 458 aa  62  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  34.06 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  32.5 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  30.4 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  30.4 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  30.4 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  30.82 
 
 		 456 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  30.95 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  32.39 
 
 		 455 aa  59.3  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6088  protein of unknown function DUF785  28.45 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  34.88 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  29.63 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  28.19 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  35.48 
 
 		 248 aa  56.6  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  36.51 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  29.17 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  33.9 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1686  hypothetical protein  26.95 
 
 		 141 aa  55.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2188  hypothetical protein  30.4 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305325  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  28.74 
 
 		 169 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  35.48 
 
 		 159 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  28.91 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  28.57 
 
 		 274 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  29.92 
 
 		 273 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  32.26 
 
 		 179 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  31.09 
 
 		 174 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  31.45 
 
 		 206 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  32.06 
 
 		 225 aa  53.1  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  28.79 
 
 		 248 aa  53.1  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  29.6 
 
 		 239 aa  52.8  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  31.45 
 
 		 179 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  27.86 
 
 		 194 aa  52.4  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2309  hypothetical protein  31.72 
 
 		 152 aa  52.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.58 
 
 		 471 aa  52.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  30.08 
 
 		 266 aa  52.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2265  hypothetical protein  28.95 
 
 		 161 aa  52.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  26.62 
 
 		 267 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1211  hypothetical protein  29.75 
 
 		 143 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  30.65 
 
 		 179 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  28.81 
 
 		 144 aa  52.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3273  protein of unknown function DUF785  25.83 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  32.2 
 
 		 158 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02455  hypothetical protein  27.87 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  29.77 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  31.09 
 
 		 174 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  29.01 
 
 		 165 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  31.75 
 
 		 160 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  26.77 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  32.2 
 
 		 158 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  29.17 
 
 		 167 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2641  hypothetical protein  30.58 
 
 		 143 aa  49.7  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  29.41 
 
 		 227 aa  49.7  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  29.6 
 
 		 172 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  26.87 
 
 		 181 aa  49.7  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  29.17 
 
 		 167 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  28 
 
 		 149 aa  48.9  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  29.51 
 
 		 145 aa  48.9  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  30.94 
 
 		 156 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  28.47 
 
 		 148 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  30.43 
 
 		 227 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  31.16 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  27.69 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  29.69 
 
 		 471 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  29.69 
 
 		 257 aa  47.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  31.93 
 
 		 144 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  29.77 
 
 		 153 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  30.94 
 
 		 166 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  27.54 
 
 		 178 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  29.77 
 
 		 153 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  31.2 
 
 		 167 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  29.41 
 
 		 166 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  27.89 
 
 		 166 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2354  hypothetical protein  28.91 
 
 		 163 aa  46.2  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00335238  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  28.26 
 
 		 178 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  27.74 
 
 		 146 aa  45.8  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  26.32 
 
 		 178 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  29.82 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  30 
 
 		 234 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  25.93 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  25.93 
 
 		 177 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0387  hypothetical protein  32 
 
 		 161 aa  45.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  28.26 
 
 		 178 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  28.57 
 
 		 166 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.200779 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>