123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2083 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  64.71 
 
 		 247 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  62.96 
 
 		 248 aa  331  8e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  61.35 
 
 		 251 aa  322  4e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  59.14 
 
 		 274 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  60.48 
 
 		 273 aa  295  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  60.67 
 
 		 247 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  60.67 
 
 		 247 aa  295  7e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  60.25 
 
 		 247 aa  291  9e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  58.53 
 
 		 274 aa  290  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2188  hypothetical protein  56.68 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305325  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  60.25 
 
 		 247 aa  281  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  54 
 
 		 257 aa  274  8e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  55 
 
 		 239 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  34.11 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  34.55 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  36.1 
 
 		 267 aa  141  8e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  34.02 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  42.55 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  33.2 
 
 		 245 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  34.44 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  31.56 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  42.58 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  29.96 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  39.13 
 
 		 254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  31.45 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  30.16 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  40.91 
 
 		 167 aa  99  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  39.01 
 
 		 189 aa  98.6  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  40.46 
 
 		 167 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  36.11 
 
 		 166 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  36.11 
 
 		 166 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  39.23 
 
 		 308 aa  96.7  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  36.11 
 
 		 166 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  32.48 
 
 		 172 aa  96.3  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  37.5 
 
 		 166 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  42.03 
 
 		 182 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  35.34 
 
 		 174 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  37.67 
 
 		 169 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  37.67 
 
 		 234 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  35.07 
 
 		 174 aa  89  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  36.55 
 
 		 199 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  34.07 
 
 		 167 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  32.41 
 
 		 167 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  33.78 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  34.25 
 
 		 178 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  35.54 
 
 		 627 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  38.46 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  32.89 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  30.14 
 
 		 170 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  33.33 
 
 		 458 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  30.77 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  33.1 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  30.82 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  30.82 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  30.77 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  32.41 
 
 		 459 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  33.81 
 
 		 160 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  30.82 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  30.82 
 
 		 178 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  30.14 
 
 		 151 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  27.63 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  29.69 
 
 		 626 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  31.08 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  28.15 
 
 		 157 aa  69.3  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  30 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  31.69 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  29.81 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  30.88 
 
 		 145 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  31.88 
 
 		 154 aa  68.6  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  31.3 
 
 		 160 aa  68.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  32.24 
 
 		 147 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0026  hypothetical protein  26.95 
 
 		 165 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  34.03 
 
 		 145 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1093  hypothetical protein  26.95 
 
 		 165 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2064  hypothetical protein  29.5 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  32.39 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  35.07 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  32.39 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  31.39 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  32.62 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  29.05 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0084  hypothetical protein  31.08 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0099  hypothetical protein  31.08 
 
 		 175 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  33.81 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  30.23 
 
 		 149 aa  61.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  29.17 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  32.62 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  32.62 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  32.62 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  32.62 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2978  hypothetical protein  39.51 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148956  normal  0.0419539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3666  hypothetical protein  28.47 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  30.25 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  32.62 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  31.43 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2219  hypothetical protein  27.27 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0902301  normal  0.0781423 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>