125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0452 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  100 
 
 		 149 aa  306  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  64.71 
 
 		 154 aa  187  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2309  hypothetical protein  60 
 
 		 152 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  59.12 
 
 		 165 aa  173  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  54.79 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1550  hypothetical protein  60.71 
 
 		 164 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2641  hypothetical protein  53.47 
 
 		 143 aa  168  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1211  hypothetical protein  55.56 
 
 		 143 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2354  hypothetical protein  53.52 
 
 		 163 aa  161  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00335238  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0387  hypothetical protein  56.39 
 
 		 161 aa  156  8e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  53.28 
 
 		 157 aa  153  7e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  48.91 
 
 		 455 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  54.14 
 
 		 147 aa  150  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  52.94 
 
 		 471 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  44.68 
 
 		 458 aa  144  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0613  protein of unknown function DUF785  51.88 
 
 		 146 aa  143  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.583928 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  49.25 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2265  hypothetical protein  52.59 
 
 		 161 aa  136  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  43.26 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23190  hypothetical protein  48.55 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  52.31 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  46.76 
 
 		 159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  42.65 
 
 		 456 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  46.38 
 
 		 179 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  45.45 
 
 		 206 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  45.45 
 
 		 179 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  39.04 
 
 		 160 aa  124  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  44.76 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  45.32 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  45.32 
 
 		 158 aa  123  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  46.53 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  44.9 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  40.44 
 
 		 459 aa  120  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  47.66 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  47.66 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  39.58 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  44.2 
 
 		 148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  45.11 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  44.36 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  40.3 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3666  hypothetical protein  41.35 
 
 		 141 aa  104  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  45.53 
 
 		 144 aa  100  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  39.71 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  48.91 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  36.23 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  37.8 
 
 		 199 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  34.46 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  36.55 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  36.55 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  31.69 
 
 		 227 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  29.93 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  35.33 
 
 		 169 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  35.86 
 
 		 178 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  32.67 
 
 		 277 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  35.86 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  34.65 
 
 		 267 aa  74.7  0.0000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  35.33 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  36.11 
 
 		 170 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  35.66 
 
 		 189 aa  73.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  33.1 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  31.88 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  33.1 
 
 		 179 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  30.82 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  33.79 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  34.81 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  31.58 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6088  protein of unknown function DUF785  30.88 
 
 		 162 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  33.77 
 
 		 166 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  32.88 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  32.41 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  30.71 
 
 		 266 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  31.65 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  36.69 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1686  hypothetical protein  30.77 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  34.85 
 
 		 182 aa  67  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  31.69 
 
 		 166 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  30.2 
 
 		 167 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  33.1 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  33.1 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  34.71 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  29.63 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  28.08 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2273  hypothetical protein  29.51 
 
 		 316 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047797  n/a   
 
 
 
NC_013037  Dfer_3273  protein of unknown function DUF785  30.37 
 
 		 152 aa  63.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  32.58 
 
 		 167 aa  63.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  33.61 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02455  hypothetical protein  26.76 
 
 		 152 aa  62  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  31.39 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  31.39 
 
 		 247 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  30.15 
 
 		 239 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  31.39 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  30.43 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  31.39 
 
 		 247 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  28.86 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  30.23 
 
 		 245 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  35.54 
 
 		 248 aa  60.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  29.69 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  29.69 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>