125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2272 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  37.85 
 
 		 268 aa  140  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  36.14 
 
 		 267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  36.33 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  47.73 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  49.24 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  49.24 
 
 		 245 aa  122  8e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  49.25 
 
 		 222 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  34.38 
 
 		 274 aa  120  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  33.86 
 
 		 274 aa  119  7e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  42.76 
 
 		 256 aa  119  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  33.2 
 
 		 273 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  37.16 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  44.78 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  46.56 
 
 		 251 aa  110  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  41.72 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  44.19 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  43.51 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  43.51 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  37.77 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  43.51 
 
 		 247 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  44.27 
 
 		 247 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  37.76 
 
 		 247 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  44.7 
 
 		 248 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  47.06 
 
 		 227 aa  106  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2188  hypothetical protein  41.54 
 
 		 256 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305325  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  39.42 
 
 		 167 aa  103  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  34.66 
 
 		 172 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  36.76 
 
 		 174 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  36.03 
 
 		 174 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  40.62 
 
 		 189 aa  94.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  39.72 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  39.23 
 
 		 245 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  37.75 
 
 		 178 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  38.46 
 
 		 182 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  37.88 
 
 		 181 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  37.09 
 
 		 178 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  37.09 
 
 		 184 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  36.96 
 
 		 179 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  37.09 
 
 		 178 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  36.3 
 
 		 167 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  36.96 
 
 		 177 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  35.66 
 
 		 166 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  35.66 
 
 		 166 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  35.92 
 
 		 170 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  35.61 
 
 		 167 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  36.99 
 
 		 178 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  34.48 
 
 		 178 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  36.3 
 
 		 178 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  34.11 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  33.85 
 
 		 166 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  35.62 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  35.66 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  38.36 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  34.33 
 
 		 199 aa  82  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  35.34 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  32.68 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  34.59 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  39.23 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  33.58 
 
 		 627 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  31.47 
 
 		 180 aa  75.1  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0099  hypothetical protein  29.61 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0084  hypothetical protein  30.07 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  32.85 
 
 		 626 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  37.69 
 
 		 146 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  33.33 
 
 		 151 aa  72  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  37.07 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  35.71 
 
 		 458 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2064  hypothetical protein  28.67 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2219  hypothetical protein  29.66 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0902301  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  36.36 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  34.97 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  36.29 
 
 		 156 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  35 
 
 		 179 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  35.71 
 
 		 148 aa  66.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  37.39 
 
 		 206 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1639  hypothetical protein  27.98 
 
 		 321 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0464228 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  33.93 
 
 		 144 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  35.48 
 
 		 166 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  35.29 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  37.86 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  38.66 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1631  hypothetical protein  27.98 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  35.29 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  34.29 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  34.62 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2601  hypothetical protein  27.46 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  36.61 
 
 		 154 aa  62  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  33.55 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  31.85 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  35.04 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1706  hypothetical protein  26.29 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604018  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  35.04 
 
 		 153 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  32.31 
 
 		 142 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2473  hypothetical protein  28.67 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2309  hypothetical protein  36.61 
 
 		 152 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  33.33 
 
 		 455 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2978  hypothetical protein  45.33 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148956  normal  0.0419539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  33.83 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>