116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00619 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  100 
 
 		 627 aa  1284    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  83.57 
 
 		 626 aa  1074    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  36.42 
 
 		 274 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  39.29 
 
 		 222 aa  92  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  37.76 
 
 		 251 aa  90.5  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  35.76 
 
 		 274 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  35.82 
 
 		 247 aa  88.2  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  35.07 
 
 		 247 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  35.07 
 
 		 247 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  36.36 
 
 		 227 aa  87.4  7e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  36.57 
 
 		 273 aa  87  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  35.07 
 
 		 247 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  34.56 
 
 		 245 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  32.9 
 
 		 256 aa  85.9  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  34.93 
 
 		 248 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  31.39 
 
 		 248 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  30.26 
 
 		 167 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  35.59 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  32.12 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  35.54 
 
 		 245 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  34.71 
 
 		 178 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  34.33 
 
 		 239 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  32.76 
 
 		 225 aa  79  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  35.19 
 
 		 178 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  35.19 
 
 		 184 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  33.61 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  33.58 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  35.19 
 
 		 178 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  30.88 
 
 		 277 aa  75.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  34.82 
 
 		 179 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  33.62 
 
 		 227 aa  75.5  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  34.82 
 
 		 177 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  33.6 
 
 		 181 aa  72  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2473  hypothetical protein  33.9 
 
 		 291 aa  72  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  35.51 
 
 		 178 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  31.94 
 
 		 167 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  30.77 
 
 		 167 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  32.23 
 
 		 178 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2273  hypothetical protein  27.59 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047797  n/a   
 
 
 
NC_008345  Sfri_2188  hypothetical protein  33.82 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  35.51 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  31.34 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  32.77 
 
 		 178 aa  69.3  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  31.25 
 
 		 267 aa  69.7  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1631  hypothetical protein  27.52 
 
 		 321 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  31.16 
 
 		 167 aa  68.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1639  hypothetical protein  27.52 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0464228 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  28.87 
 
 		 166 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  33.07 
 
 		 170 aa  68.6  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2601  hypothetical protein  34.11 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  27.81 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  33.33 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  32.56 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1564  hypothetical protein  26.61 
 
 		 321 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  30.77 
 
 		 234 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2219  hypothetical protein  20.82 
 
 		 308 aa  66.6  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0902301  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0099  hypothetical protein  34.96 
 
 		 175 aa  66.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  27.08 
 
 		 266 aa  65.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1706  hypothetical protein  33.05 
 
 		 294 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  30.94 
 
 		 199 aa  66.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  32.41 
 
 		 182 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0026  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1093  hypothetical protein  29.41 
 
 		 165 aa  65.9  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  29.1 
 
 		 166 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  29.1 
 
 		 166 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0084  hypothetical protein  33.61 
 
 		 175 aa  65.1  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1956  hypothetical protein  31.3 
 
 		 289 aa  64.7  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221444  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  30.77 
 
 		 169 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  32.5 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  29.84 
 
 		 189 aa  63.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  29.63 
 
 		 254 aa  63.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  35.92 
 
 		 180 aa  62  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  29.69 
 
 		 148 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  31.97 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  31.97 
 
 		 179 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  31.15 
 
 		 179 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  28.57 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  28.68 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  31.15 
 
 		 206 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  31.97 
 
 		 159 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  28.91 
 
 		 157 aa  58.5  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  29.13 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  31.4 
 
 		 151 aa  57  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  55.5  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3666  hypothetical protein  27.41 
 
 		 141 aa  55.5  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1686  hypothetical protein  25.93 
 
 		 141 aa  54.7  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0613  protein of unknown function DUF785  27.83 
 
 		 146 aa  54.3  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.583928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  54.3  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  26.21 
 
 		 146 aa  54.3  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  29.73 
 
 		 149 aa  54.3  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  29.17 
 
 		 144 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  27.82 
 
 		 166 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  28.69 
 
 		 158 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  25 
 
 		 471 aa  52.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  26.27 
 
 		 149 aa  51.6  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  27.83 
 
 		 153 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  27.83 
 
 		 153 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>