104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2219 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2219  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  625  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0902301  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2064  hypothetical protein  76.74 
 
 		 289 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2601  hypothetical protein  73.26 
 
 		 289 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2473  hypothetical protein  76.95 
 
 		 291 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1564  hypothetical protein  69.26 
 
 		 321 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1639  hypothetical protein  68.15 
 
 		 321 aa  388  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0464228 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1631  hypothetical protein  68.27 
 
 		 321 aa  388  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1956  hypothetical protein  62.54 
 
 		 289 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221444  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1706  hypothetical protein  62.37 
 
 		 294 aa  354  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604018  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2273  hypothetical protein  59.17 
 
 		 316 aa  338  8e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047797  n/a   
 
 
 
NC_011313  VSAL_II0026  hypothetical protein  48.53 
 
 		 165 aa  139  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1093  hypothetical protein  48.53 
 
 		 165 aa  139  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  29.63 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  29.66 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  20.82 
 
 		 627 aa  66.6  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  21.84 
 
 		 626 aa  66.2  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  28.97 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  28.97 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  28.97 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6088  protein of unknown function DUF785  30.22 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  28.97 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  33.09 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  29.73 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  27.61 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1686  hypothetical protein  28.47 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  25.32 
 
 		 458 aa  59.3  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  26.71 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  29.66 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  26.71 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  26.92 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  27.27 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  23.23 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  31.88 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  29.2 
 
 		 149 aa  57  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  26.03 
 
 		 459 aa  56.2  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  30.22 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  30.82 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  26.03 
 
 		 456 aa  55.8  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  25.9 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02455  hypothetical protein  30.71 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  25.64 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  26.24 
 
 		 227 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  26.21 
 
 		 142 aa  53.9  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2641  hypothetical protein  26.71 
 
 		 143 aa  52.8  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.16 
 
 		 471 aa  52.8  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  27.01 
 
 		 189 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  28.08 
 
 		 179 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  24 
 
 		 169 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  29.29 
 
 		 166 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  24.66 
 
 		 248 aa  52.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  27.27 
 
 		 153 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  27.4 
 
 		 172 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  27.27 
 
 		 153 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  25.34 
 
 		 142 aa  52.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  26.76 
 
 		 181 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2188  hypothetical protein  25.17 
 
 		 256 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305325  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  28.39 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  27.92 
 
 		 156 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  25.85 
 
 		 149 aa  51.6  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  25 
 
 		 147 aa  50.8  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3273  protein of unknown function DUF785  26.21 
 
 		 152 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  27.4 
 
 		 206 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  27.4 
 
 		 179 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  31.75 
 
 		 145 aa  49.7  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  27.4 
 
 		 179 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2309  hypothetical protein  27.86 
 
 		 152 aa  49.7  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  25.53 
 
 		 148 aa  49.3  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  24.87 
 
 		 194 aa  49.3  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  26.67 
 
 		 159 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1211  hypothetical protein  24.17 
 
 		 143 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  23.68 
 
 		 199 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  29.45 
 
 		 167 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  27.44 
 
 		 178 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  25.17 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  27.81 
 
 		 178 aa  47  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  22.46 
 
 		 247 aa  47  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  26.06 
 
 		 167 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  27.7 
 
 		 227 aa  46.6  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  23.93 
 
 		 160 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23190  hypothetical protein  32 
 
 		 176 aa  46.6  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  25.81 
 
 		 179 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  23.84 
 
 		 225 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  27.92 
 
 		 158 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  27.41 
 
 		 158 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  28.81 
 
 		 144 aa  45.8  0.0009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  30 
 
 		 182 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0613  protein of unknown function DUF785  24.82 
 
 		 146 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.583928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  29.27 
 
 		 148 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  26.96 
 
 		 174 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2354  hypothetical protein  21.74 
 
 		 163 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00335238  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  22.5 
 
 		 165 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  28.69 
 
 		 174 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  26.32 
 
 		 177 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  25.35 
 
 		 167 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1550  hypothetical protein  30.89 
 
 		 164 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2265  hypothetical protein  24.82 
 
 		 161 aa  43.1  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>