124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2084 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  564  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  96.35 
 
 
274 aa  545  1e-154  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  93.8 
 
 
273 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  66.13 
 
 
247 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  66.13 
 
 
247 aa  346  2e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  66.13 
 
 
247 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  66.4 
 
 
247 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  58.91 
 
 
251 aa  310  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  59.04 
 
 
247 aa  295  4e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  57.6 
 
 
257 aa  293  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  58.53 
 
 
245 aa  290  2e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  59.13 
 
 
248 aa  286  2e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2188  hypothetical protein  57.37 
 
 
256 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  57.37 
 
 
239 aa  278  6e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  34.33 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  33.71 
 
 
245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  32.39 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  30.43 
 
 
248 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  33.47 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  42.86 
 
 
227 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  45.58 
 
 
222 aa  133  3.9999999999999996e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  47.55 
 
 
227 aa  132  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  41.61 
 
 
225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  32.32 
 
 
277 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  34.38 
 
 
308 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  37.75 
 
 
254 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  35.48 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  34.42 
 
 
172 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  32.02 
 
 
266 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  34.81 
 
 
189 aa  99  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  38.46 
 
 
167 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  37.5 
 
 
166 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  35.42 
 
 
166 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  35.42 
 
 
166 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  38.36 
 
 
169 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  36.17 
 
 
167 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  34.72 
 
 
166 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  35.29 
 
 
167 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  37.67 
 
 
234 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  36.42 
 
 
627 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  34.33 
 
 
174 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  35 
 
 
199 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  37.13 
 
 
178 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  33.58 
 
 
174 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  35.76 
 
 
178 aa  89  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  33.56 
 
 
170 aa  89  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  41.53 
 
 
194 aa  87.4  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  29.45 
 
 
181 aa  87  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  34.01 
 
 
167 aa  87  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  34.44 
 
 
626 aa  86.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  35.76 
 
 
179 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  35.76 
 
 
177 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  35.62 
 
 
178 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  34.46 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  34.93 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  34.93 
 
 
184 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  35.37 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  34.46 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  34.93 
 
 
178 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  37.31 
 
 
182 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  79  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  33.33 
 
 
458 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  30.6 
 
 
456 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1093  hypothetical protein  29.8 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0026  hypothetical protein  29.8 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  31.34 
 
 
459 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  32.7 
 
 
455 aa  75.9  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  31.72 
 
 
142 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0099  hypothetical protein  34.09 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0084  hypothetical protein  34.09 
 
 
175 aa  73.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  32.82 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  33.77 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  30.34 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  32.17 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  29.77 
 
 
151 aa  68.6  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  32.61 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  30.53 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  31.47 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  31.21 
 
 
145 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  34.9 
 
 
179 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  34.9 
 
 
179 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  32.85 
 
 
149 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  29.85 
 
 
147 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  34.9 
 
 
179 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  34.9 
 
 
206 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  29.86 
 
 
153 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  29.86 
 
 
153 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  34.25 
 
 
158 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  28.26 
 
 
148 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2064  hypothetical protein  26.9 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  31.25 
 
 
166 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  33.56 
 
 
158 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  33.06 
 
 
144 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  31.69 
 
 
144 aa  59.7  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  34.25 
 
 
159 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  29.69 
 
 
149 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3666  hypothetical protein  28.99 
 
 
141 aa  59.3  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  24.46 
 
 
146 aa  59.3  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2219  hypothetical protein  26.71 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0902301  normal  0.0781423 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>