119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0026 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0026  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1093  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2219  hypothetical protein  45.16 
 
 		 308 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0902301  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1706  hypothetical protein  43.75 
 
 		 294 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604018  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2064  hypothetical protein  42.95 
 
 		 289 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2601  hypothetical protein  45.16 
 
 		 289 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1564  hypothetical protein  48.15 
 
 		 321 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1631  hypothetical protein  48.15 
 
 		 321 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1956  hypothetical protein  42.42 
 
 		 289 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221444  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1639  hypothetical protein  47.37 
 
 		 321 aa  133  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0464228 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2473  hypothetical protein  50.36 
 
 		 291 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2273  hypothetical protein  41.98 
 
 		 316 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047797  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  30.46 
 
 		 273 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  30.46 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  34.78 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  28.66 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  29.8 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  35.21 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  36.17 
 
 		 248 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  28.08 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  28.08 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  28.08 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2188  hypothetical protein  31.39 
 
 		 256 aa  72  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305325  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  28.77 
 
 		 247 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  30.5 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  30.99 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  32.12 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  29.73 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  30.22 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  29.41 
 
 		 626 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  27.68 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  26.95 
 
 		 245 aa  67  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  28.87 
 
 		 222 aa  67  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  27.54 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  29.41 
 
 		 627 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  29.85 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  29.85 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  29.33 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  27.86 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  25.64 
 
 		 180 aa  63.9  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  30.19 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  25.16 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  29.1 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  29.27 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  31.62 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  29.1 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  28.05 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1686  hypothetical protein  29.58 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  29.6 
 
 		 156 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3273  protein of unknown function DUF785  27.86 
 
 		 152 aa  62.4  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  27.59 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02455  hypothetical protein  27.97 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  29.45 
 
 		 277 aa  62  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  28.87 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  31.91 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  26.99 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  31.08 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  26.24 
 
 		 254 aa  60.8  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  28.89 
 
 		 167 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  25 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  28.21 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  28.78 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  32.59 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  24.82 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  26.85 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  27.85 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  30.66 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  29.45 
 
 		 308 aa  58.2  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6088  protein of unknown function DUF785  28.06 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  28.99 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  27.86 
 
 		 458 aa  57.4  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  27.95 
 
 		 178 aa  57  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  31.39 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  32.59 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  29.25 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  32.84 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  29.27 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  26.61 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  28.89 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  30.43 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  27.94 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  26.61 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  29.27 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  29.41 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  32 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  27.74 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  29.19 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  29.08 
 
 		 455 aa  53.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  28.78 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  32 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  26.61 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  27.5 
 
 		 194 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  29.08 
 
 		 459 aa  53.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  33.62 
 
 		 144 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  26.62 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  30.82 
 
 		 178 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  25.9 
 
 		 160 aa  52  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  33.09 
 
 		 456 aa  52  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  32.19 
 
 		 183 aa  51.6  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0613  protein of unknown function DUF785  24.82 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.583928 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>