101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02455 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02455  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  305  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1686  hypothetical protein  43.41 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6088  protein of unknown function DUF785  36 
 
 
162 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3273  protein of unknown function DUF785  32.64 
 
 
152 aa  92.8  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  32.09 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  33.08 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  34.81 
 
 
144 aa  78.2  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  33.55 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  39.13 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  34.07 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  33.82 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3666  hypothetical protein  30.43 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  30.07 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  32.88 
 
 
160 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  30.94 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  32.85 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  36.36 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  31.88 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  34.38 
 
 
166 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0613  protein of unknown function DUF785  30.99 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.583928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  31.82 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  32.59 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  31.39 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  31.39 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  31.75 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0387  hypothetical protein  32.77 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  32.33 
 
 
458 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  29.25 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  31.21 
 
 
471 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  32.23 
 
 
179 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  29.5 
 
 
146 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2309  hypothetical protein  30.94 
 
 
152 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1211  hypothetical protein  30.15 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  31.71 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  31.01 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  31.71 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  28.36 
 
 
459 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.54 
 
 
471 aa  63.5  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  23.65 
 
 
456 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1550  hypothetical protein  29.8 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0026  hypothetical protein  27.97 
 
 
165 aa  62  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1093  hypothetical protein  27.97 
 
 
165 aa  62  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  27.82 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23190  hypothetical protein  28.89 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2265  hypothetical protein  27.74 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  29.63 
 
 
455 aa  62  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  26.76 
 
 
149 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2641  hypothetical protein  28.57 
 
 
143 aa  61.6  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  32.48 
 
 
144 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2354  hypothetical protein  28.08 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00335238  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1706  hypothetical protein  29.85 
 
 
294 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604018  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  27.41 
 
 
194 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2473  hypothetical protein  31.34 
 
 
291 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  28.15 
 
 
181 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2219  hypothetical protein  30.71 
 
 
308 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0902301  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  25.87 
 
 
160 aa  55.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  29.94 
 
 
274 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2601  hypothetical protein  31.11 
 
 
289 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2273  hypothetical protein  32.14 
 
 
316 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047797  n/a   
 
 
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  31.85 
 
 
273 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  30.38 
 
 
274 aa  54.3  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  31.06 
 
 
247 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2064  hypothetical protein  30.5 
 
 
289 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  32.81 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1639  hypothetical protein  27.94 
 
 
321 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0464228 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  36.45 
 
 
222 aa  51.6  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1956  hypothetical protein  27.87 
 
 
289 aa  51.2  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221444  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  29.36 
 
 
245 aa  50.8  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0084  hypothetical protein  31.54 
 
 
175 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1564  hypothetical protein  26.87 
 
 
321 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  31.82 
 
 
247 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  31.82 
 
 
247 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  31.82 
 
 
247 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  29.77 
 
 
267 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1631  hypothetical protein  26.87 
 
 
321 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  26.22 
 
 
199 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  28.35 
 
 
225 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  29.92 
 
 
227 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  29.09 
 
 
248 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  25.45 
 
 
277 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  31.78 
 
 
227 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  29.92 
 
 
627 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0099  hypothetical protein  30 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  32.17 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  31.3 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  29.69 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  27.21 
 
 
257 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  30.23 
 
 
234 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  45.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  26.15 
 
 
189 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  28.18 
 
 
248 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  31.53 
 
 
251 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  28.83 
 
 
256 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  22.48 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  25.34 
 
 
254 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  30.28 
 
 
308 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  29.51 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  25.93 
 
 
178 aa  43.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  28.75 
 
 
626 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  24.09 
 
 
266 aa  41.2  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>