100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3273 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3273  protein of unknown function DUF785  100 
 
 		 152 aa  312  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6088  protein of unknown function DUF785  48.65 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02455  hypothetical protein  32.64 
 
 		 152 aa  92.8  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2641  hypothetical protein  33.81 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1211  hypothetical protein  34.53 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1686  hypothetical protein  32.86 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  33.58 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  33.1 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  32.84 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  33.81 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  35.34 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  33.09 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  35.88 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0613  protein of unknown function DUF785  33.57 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.583928 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3666  hypothetical protein  34.27 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2265  hypothetical protein  32.65 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  30.28 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  32.59 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  36.43 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  30 
 
 		 459 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  32.64 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  32.58 
 
 		 456 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  32.58 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  32.31 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  31.3 
 
 		 222 aa  64.3  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  31.58 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  31.62 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  28.99 
 
 		 247 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  31.62 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  30.37 
 
 		 149 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1093  hypothetical protein  27.86 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0026  hypothetical protein  27.86 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  31.82 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  31.34 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  29.85 
 
 		 455 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  31.11 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  30.66 
 
 		 158 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  33.04 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2309  hypothetical protein  31.11 
 
 		 152 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  28.26 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  28.26 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  28.26 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  28.24 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  28.99 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  34.75 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2273  hypothetical protein  27.78 
 
 		 316 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047797  n/a   
 
 
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  29.2 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  28.57 
 
 		 274 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  28.06 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  28.57 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1550  hypothetical protein  30.3 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  27.73 
 
 		 274 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  30.77 
 
 		 471 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  28.57 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  30.15 
 
 		 179 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  30.7 
 
 		 248 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  28.17 
 
 		 266 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  28.89 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  28.26 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  30.15 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23190  hypothetical protein  28.24 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  30.7 
 
 		 245 aa  57  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  30.15 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  27.5 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  24.41 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  30.83 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  31.53 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2354  hypothetical protein  27.56 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00335238  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0387  hypothetical protein  29.77 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2473  hypothetical protein  25.36 
 
 		 291 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  29.41 
 
 		 179 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  25.41 
 
 		 247 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  24.44 
 
 		 194 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  30.97 
 
 		 248 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  26.23 
 
 		 227 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2601  hypothetical protein  25.87 
 
 		 289 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  26.89 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1639  hypothetical protein  28.57 
 
 		 321 aa  52  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0464228 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1564  hypothetical protein  30 
 
 		 321 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1631  hypothetical protein  30 
 
 		 321 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  30.77 
 
 		 174 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1956  hypothetical protein  25.83 
 
 		 289 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.221444  normal  0.579139 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2219  hypothetical protein  26.21 
 
 		 308 aa  50.8  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0902301  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  30.77 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2188  hypothetical protein  30.97 
 
 		 256 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305325  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0769  SSU ribosomal protein S6P modification protein  28.8 
 
 		 471 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.974202  normal  0.327706 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  28.32 
 
 		 257 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2064  hypothetical protein  27.34 
 
 		 289 aa  48.9  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  26.55 
 
 		 239 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  25.23 
 
 		 248 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  24 
 
 		 267 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  25.23 
 
 		 245 aa  47.4  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  24.59 
 
 		 308 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1706  hypothetical protein  24.79 
 
 		 294 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604018  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0084  hypothetical protein  31.73 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  27.48 
 
 		 627 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  27.07 
 
 		 626 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  25 
 
 		 172 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>