125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1082 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  367  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  46.75 
 
 
189 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  40.76 
 
 
199 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  40.37 
 
 
194 aa  122  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  39.44 
 
 
182 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  38.81 
 
 
167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  40.82 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  44.7 
 
 
174 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  43.94 
 
 
174 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  40.41 
 
 
277 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  37.34 
 
 
180 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  38.73 
 
 
248 aa  102  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  35.97 
 
 
267 aa  99.8  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  40.43 
 
 
178 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  38.85 
 
 
245 aa  99  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  37.5 
 
 
248 aa  97.1  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  37.2 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  40.43 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  35.25 
 
 
256 aa  95.5  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  39.29 
 
 
177 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  39.29 
 
 
179 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  39.72 
 
 
183 aa  94  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  36.97 
 
 
178 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  36.6 
 
 
268 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  36.97 
 
 
184 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  38.62 
 
 
166 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  40.69 
 
 
166 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  36.36 
 
 
178 aa  92  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  40 
 
 
166 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  37.88 
 
 
308 aa  91.7  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  38.85 
 
 
178 aa  91.3  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  36.36 
 
 
178 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  40 
 
 
167 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  32.85 
 
 
239 aa  88.2  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  36 
 
 
167 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  38.52 
 
 
167 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  29.45 
 
 
274 aa  87  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  28.83 
 
 
274 aa  86.3  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  30.77 
 
 
273 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  33.33 
 
 
151 aa  85.9  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  32.14 
 
 
257 aa  84.3  8e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  32.28 
 
 
266 aa  84.3  9e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  38.14 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  36 
 
 
170 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2188  hypothetical protein  31.88 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  36.69 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  38.35 
 
 
169 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  31.16 
 
 
251 aa  82  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  31.88 
 
 
247 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  39.1 
 
 
234 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  31.88 
 
 
247 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  31.88 
 
 
247 aa  81.3  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  33.57 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  30.71 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  31.33 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0263  hypothetical protein  37.98 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.315949 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  34.56 
 
 
157 aa  79.7  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  35.29 
 
 
225 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23190  hypothetical protein  32.61 
 
 
176 aa  79  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  34.07 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  36.13 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  31.16 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  37.72 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  30.66 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  33.09 
 
 
153 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  33.09 
 
 
153 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  30.82 
 
 
227 aa  78.6  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  33.33 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  29.93 
 
 
149 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  32.87 
 
 
458 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  31.03 
 
 
145 aa  75.5  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68640  hypothetical protein  36.84 
 
 
144 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5940  hypothetical protein  36.28 
 
 
166 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  29.29 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  34.23 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0274  hypothetical protein  34.09 
 
 
179 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4963  hypothetical protein  34.09 
 
 
179 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000828049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0249  hypothetical protein  34.09 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0170407 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  33.57 
 
 
154 aa  72.4  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2641  hypothetical protein  31.88 
 
 
143 aa  72  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  33.6 
 
 
627 aa  72  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2273  hypothetical protein  31.91 
 
 
316 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047797  n/a   
 
 
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  27.86 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  31.21 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0264  hypothetical protein  34.38 
 
 
179 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.685776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0235  hypothetical protein  34.88 
 
 
158 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  33.08 
 
 
456 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0099  hypothetical protein  34.59 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3341  ribosomal protein S6 modification protein  30.28 
 
 
471 aa  68.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  34.11 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0084  hypothetical protein  34.59 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  33.88 
 
 
626 aa  67.8  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3666  hypothetical protein  28.78 
 
 
141 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6088  protein of unknown function DUF785  32.37 
 
 
162 aa  67.4  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  35.04 
 
 
145 aa  67  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  31.69 
 
 
455 aa  67  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  28.86 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1706  hypothetical protein  28.26 
 
 
294 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.604018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>