123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1891 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1891  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  533  1e-150  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2188  hypothetical protein  71.6 
 
 		 256 aa  381  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305325  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1894  hypothetical protein  58.8 
 
 		 274 aa  295  6e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2084  hypothetical protein  57.6 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.445635 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1949  hypothetical protein  57.66 
 
 		 273 aa  288  4e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2026  hypothetical protein  56.45 
 
 		 247 aa  280  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2036  protein of unknown function DUF785  54.09 
 
 		 247 aa  278  9e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00734805  hitchhiker  0.0000094043 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2311  hypothetical protein  54.47 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.13681  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2427  hypothetical protein  54.47 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115437  normal  0.424192 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2083  hypothetical protein  54 
 
 		 245 aa  274  9e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2579  hypothetical protein  56.22 
 
 		 248 aa  272  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000115581  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2370  hypothetical protein  53.2 
 
 		 251 aa  270  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0010262  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2034  hypothetical protein  55.25 
 
 		 247 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1847  hypothetical protein  54.55 
 
 		 239 aa  259  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.359209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003930  hypothetical protein  35.6 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116829  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0731  putative lipoprotein  36.19 
 
 		 245 aa  138  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000365202  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1883  putative lipoprotein  31.4 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1105  hypothetical protein  36 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01593  hypothetical protein  31.56 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05720  hypothetical protein  36.6 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000112  hypothetical protein  35.63 
 
 		 227 aa  125  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0448  putative lipoprotein  44.93 
 
 		 227 aa  123  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1879  hypothetical protein  34.16 
 
 		 277 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.257149  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0788  putative lipoprotein  41.55 
 
 		 222 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3348  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  38.62 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00039365  normal  0.0334035 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2272  hypothetical protein  42.55 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.245228  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2042  hypothetical protein  30 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4725  hypothetical protein  37.41 
 
 		 167 aa  99.4  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.541048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0771  hypothetical protein  28.52 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.104884  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0451  hypothetical protein  38.13 
 
 		 167 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1069  hypothetical protein  36.76 
 
 		 189 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.589582  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17820  hypothetical protein  36.57 
 
 		 167 aa  93.6  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0333  hypothetical protein  34.67 
 
 		 166 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.200779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0356  hypothetical protein  34.67 
 
 		 166 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.685445  normal  0.682282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4872  hypothetical protein  34.87 
 
 		 166 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.685348  normal  0.205038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0359  hypothetical protein  34.87 
 
 		 166 aa  92  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.421684  normal  0.231317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0567  hypothetical protein  36.18 
 
 		 169 aa  92  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0680548  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05970  hypothetical protein  34.59 
 
 		 174 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.147073 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3694  hypothetical protein  36.88 
 
 		 199 aa  92  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.809592  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2935  protein of unknown function DUF785  33.74 
 
 		 172 aa  89.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0561  hypothetical protein  34.33 
 
 		 174 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41690  hypothetical protein  36.24 
 
 		 179 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2078  hypothetical protein  37.67 
 
 		 178 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.276405  normal  0.205084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06040  hypothetical protein  35.53 
 
 		 234 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0137157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3539  hypothetical protein  36.24 
 
 		 177 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1082  hypothetical protein  32.14 
 
 		 181 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.443208  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1762  hypothetical protein  35.14 
 
 		 178 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.399192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5197  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23190  hypothetical protein  35.37 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2332  hypothetical protein  34.93 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2285  hypothetical protein  34.46 
 
 		 183 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.080209  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4123  hypothetical protein  32.19 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3438  hypothetical protein  34.93 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00573127  normal  0.0618334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1933  hypothetical protein  34.93 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.160249  hitchhiker  0.00000000262846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1773  hypothetical protein  34.93 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.315144  hitchhiker  0.00000690981 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0580  hypothetical protein  38.46 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2429  protein of unknown function DUF785  38.81 
 
 		 182 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0685  hypothetical protein  36.05 
 
 		 160 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000172197  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2826  aspartyl protease  31.58 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.65753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2083  hypothetical protein  33.56 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415599  hitchhiker  0.00412014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2099  hypothetical protein  31.88 
 
 		 157 aa  72  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000826  hypothetical protein  31.47 
 
 		 142 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00006699  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1241  hypothetical protein  33.81 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0335249  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1093  hypothetical protein  30.99 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00619  hypothetical protein  31.34 
 
 		 627 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06735  hypothetical protein  31.51 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0026  hypothetical protein  30.99 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2582  alpha-L-glutamate ligase  29.73 
 
 		 455 aa  69.7  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.151882  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2063  hypothetical protein  32.06 
 
 		 180 aa  68.2  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000388438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3966  alpha-L-glutamate ligase  34.45 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000098482  normal  0.0844879 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0099  hypothetical protein  34.07 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0084  hypothetical protein  31.85 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3667  hypothetical protein  34.56 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000287842  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2034  transglutaminase-like  32.39 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.693403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001873  hypothetical protein  29.1 
 
 		 626 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1870  hypothetical protein  31.43 
 
 		 147 aa  64.3  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2101  alpha-L-glutamate ligase  30.61 
 
 		 458 aa  64.3  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00703256  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4122  alpha-L-glutamate ligase  32.8 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000650409  hitchhiker  0.00401578 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0245  hypothetical protein  32.87 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0616  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  hitchhiker  0.000000000557594 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00714  aspartyl protease  37.61 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2411  protein of unknown function DUF785  36.8 
 
 		 153 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3700  protein of unknown function DUF785  36.8 
 
 		 153 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.382849  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1765  protein of unknown function DUF785  32.26 
 
 		 165 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.857542 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0761  hypothetical protein  26.62 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00218793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2040  hypothetical protein  29.45 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0129341 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3666  hypothetical protein  27.94 
 
 		 141 aa  58.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2064  hypothetical protein  29.2 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0613  protein of unknown function DUF785  29.17 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.583928 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0452  protein of unknown function DUF785  29.71 
 
 		 149 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.985705  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23190  hypothetical protein  29.79 
 
 		 176 aa  55.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2978  hypothetical protein  39.74 
 
 		 133 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148956  normal  0.0419539 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2219  hypothetical protein  25.64 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0902301  normal  0.0781423 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0172  hypothetical protein  35.29 
 
 		 158 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1211  hypothetical protein  31.67 
 
 		 143 aa  53.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2273  hypothetical protein  27.33 
 
 		 316 aa  52.8  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000047797  n/a   
 
 
 
NC_009901  Spea_2473  hypothetical protein  26.21 
 
 		 291 aa  52.4  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0364  hypothetical protein  31.36 
 
 		 156 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05150  hypothetical protein  30.51 
 
 		 148 aa  52  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2601  hypothetical protein  27.39 
 
 		 289 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0114575  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>